RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 SYNJ2BPP57105 145 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 PSG9Q00887 426 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 LCN12Q6JVE5 192 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 Q86TA4 180 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 WFDC3Q8IUB2 231 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 VGLL1Q99990 258 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 TCEAL7Q9BRU2 100 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 PSG8Q9UQ74 426 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 PRAC2D3DTV9 90 aa6.44□□□□□ -1.38
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CS-215ENST00000549143 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 ERCC8Q13216 396 aa6.44□□□□□ -1.38
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CS-215ENST00000549143 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa6.44□□□□□ -1.38
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CS-215ENST00000549143 C16orf92Q96LL3 132 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 C8orf49Q96NF6 230 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 PRDM13Q9H4Q3 707 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 IL36BQ9NZH7 164 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 P01737 135 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 TFPI2P48307 235 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 FOXL1Q12952 345 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 PSG3Q16557 428 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 OSTCQ9NRP0 149 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 F8P00451 2351 aa6.44□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PRX2 142 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 TRGC1P0CF51 173 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 GZMBP10144 247 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 CBLN1P23435 193 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 FAM209BQ5JX69 171 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 Q6ZSV7 163 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 TEX29Q8N6K0 151 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 TMEM190Q8WZ59 177 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 MLST8Q9BVC4 326 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 TPPP3Q9BW30 176 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 A0A087WW49 117 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 J3KRW8 73 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 HIST1H2BKO60814 126 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 HIST1H2BJP06899 126 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 HIST1H2BOP23527 126 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 HIST1H2BBP33778 126 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 HIST1H2BDP58876 126 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 HIST1H2BCP62807 126 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa6.43□□□□□ -1.38
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CS-215ENST00000549143 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 HIGD1CA8MV81 97 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 LY6G6DO95868 133 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 ELANEP08246 267 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 FOXE3Q13461 319 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 TCF24Q7RTU0 167 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 ATP6V0BQ99437 205 aa6.42□□□□□ -1.38
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CS-215ENST00000549143 BIN3Q9NQY0 253 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 A0A1W2PS18 150 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 BRI3O95415 125 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 CT45A10P0DMU9 189 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 CAMPP49913 170 aa6.42□□□□□ -1.38
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CS-215ENST00000549143 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 GLMPQ8WWB7 406 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 GRAMD2BQ96HH9 432 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 BTF3L4Q96K17 158 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 NEU1Q99519 415 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 GPR61Q9BZJ8 451 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 U3KQE9 123 aa6.42□□□□□ -1.38
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CS-215ENST00000549143 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 ZNF738Q8NE65 137 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 SNURFLB1AK76 121 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 SLURP1P55000 103 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-215ENST00000549143 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.41□□□□□ -1.38
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