RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 FOXC2Q99958 501 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 TMEM133Q9H2Q1 129 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 PRO0461Q9UI25 63 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 DNAJC13O75165 2243 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 NDUFB3O43676 98 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 ENSAO43768 121 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 IL4P05112 153 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 CRYGBP07316 175 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 WT1P19544 449 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 CD40P25942 277 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 CRYBA4P53673 196 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 MSMPQ1L6U9 139 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 HES3Q5TGS1 186 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 TMEM200BQ69YZ2 307 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 TMEM158Q8WZ71 300 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 RPEQ96AT9 228 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 SIGLEC9Q9Y336 463 aa8.53□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 TTC28Q96AY4 2481 aa8.52□□□□□ -1.04
LMO3-215ENST00000537304 TNCP24821 2201 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 DOCK7Q96N67 2140 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 TMEM8BA6NDV4 472 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 TMEM262E9PQX1 116 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 I3L2K1 104 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 TNFRSF6BO95407 300 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 FOXI1Q12951 378 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 SPRNQ5BIV9 151 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 TMEM108Q6UXF1 575 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 GTSCR1Q86UQ5 136 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 RNF125Q96EQ8 232 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 C18orf15Q96N68 181 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 ZNRD1Q9P1U0 126 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.52□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 A0A087WX48 190 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 SPINK8P0C7L1 97 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 C5orf64Q2M2E5 130 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 Q5PR19 223 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 PIP4P1Q86T03 277 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 C8orf49Q96NF6 230 aa8.51□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 TEX22C9J3V5 150 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 IGKV1-17P01599 117 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 LAGE3Q14657 143 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 PPP1R27Q86WC6 154 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 NUP37Q8NFH4 326 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 PRR25Q96S07 402 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 TPSG1Q9NRR2 321 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 ZNF318Q5VUA4 2279 aa8.5□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 TRAV17A0A0B4J275 112 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 H7C1H1 209 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 K7EMI3 77 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 TSPAN13O95857 204 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 CCL3L1P16619 93 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 OR11H6Q8NGC7 330 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 RNF185Q96GF1 192 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 TMEM160Q9NX00 188 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 DSCAMO60469 2012 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 MUC3AQ02505 3323 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 CACNA1HO95180 2353 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 SMKR1H3BMG3 65 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 SLC25A16P16260 332 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 ZNF491Q8N8L2 437 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 ERG28Q9UKR5 140 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 PCNX2A6NKB5 2137 aa8.49□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 TRAV40A0A0B4J280 105 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 FXYD7P58549 80 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 TMEM155Q4W5P6 130 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 SYT8Q8NBV8 401 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 ASCL2Q99929 193 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 VPS13AQ96RL7 3174 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 MYO15AQ9UKN7 3530 aa8.48□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 PRR14LQ5THK1 2151 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 LINC01549A6NIU2 74 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 F8VRH5 84 aa8.47□□□□□ -1.05
LMO3-215ENST00000537304 IGHV1-8P0DP01 117 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.2 ms