RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730		K7EIL1	84 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	IFNA1	P01562	189 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	HLA-DRB4	P13762	266 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	RAN	P62826	216 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	RPUSD4	Q96CM3	377 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		11.34	□□□□□ -0.59
BBS1-224	ENST00000534730	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730		F6UZH7	168 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	AMBP	P02760	352 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	ICAM4	Q14773	271 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF726P1	Q15940	193 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF503	Q96F45	646 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730		Q9H3A6	140 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		11.33	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	TRAV8-2	A0A0B4J237	113 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	NDUFB4	O95168	129 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	FHIT	P49789	147 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	FAM24B	Q8N5W8	94 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	C17orf77	Q96MU5	243 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		11.32	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	RBAKDN	A6NC62	111 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	PGP	A6NDG6	321 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730		H3BMM0	161 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	SLC17A3	O00476	420 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	SLC25A5	P05141	298 aa	Known RBP	11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	TSPO	P30536	169 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	PMS2P11	Q13670	270 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	TEX261	Q6UWH6	196 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	LINC00477	Q96M19	166 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	CSTL1	Q9H114	145 aa		11.31	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730		A0A0J9YX75	114 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730		H3BTX0	84 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	RAB14	P61106	215 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	RNF182	Q8N6D2	247 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	ODF3	Q96PU9	254 aa		11.3	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	HIST1H1A	Q02539	215 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	TMEM78	Q5T7P6	136 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	EXOC3-AS1	Q8N2X6	119 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF680	Q8NEM1	530 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	C20orf173	Q96LM9	149 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	B9D2	Q9BPU9	175 aa		11.29	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	TRBV7-9	A0A0J9YWB2	115 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	KNCN	A6PVL3	124 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	CST9LP1	Q5W188	147 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	LINC00322	Q6ZN03	302 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730		Q6ZWC4	215 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	SSX7	Q7RTT5	188 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	ZMAT4	Q9H898	229 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	LENEP	Q9Y5L5	61 aa		11.28	□□□□□ -0.6
BBS1-224	ENST00000534730	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	NMB	P08949	121 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	LEP	P41159	167 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	CNN1	P51911	297 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	ATG101	Q9BSB4	218 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	RYR2	Q92736	4967 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	FAM74A7	A6NL05	159 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730		A8MTW9	85 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	DIRC3	C9JPN6	131 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730		M0R3E3	92 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	UBE2G2	P60604	165 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	GNG13	Q9P2W3	67 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	EPDR1	Q9UM22	224 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	NPIPB6	E9PJ23	425 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	HLA-DMB	P28068	263 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	CITED4	Q96RK1	184 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-224	ENST00000534730	SPATA25	Q9BR10	227 aa		11.25	□□□□□ -0.61

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