RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 CRYZL1O95825 349 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 SULT1A1P50225 295 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 SULT1A2P50226 295 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 TAS2R30P59541 319 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 S100A10P60903 97 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 PAX8Q06710 450 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 TNFRSF9Q07011 255 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF429Q86V71 674 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 COMMD7Q86VX2 200 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM252Q8N6L7 170 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 OR2D3Q8NGH3 330 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 OR4S2Q8NH73 311 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 VN1R17PQ8TDU5 208 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 SMIM8Q96KF7 97 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 FBXL15Q9H469 300 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 EDA2RQ9HAV5 297 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM14BQ9NUH8 114 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 INSIG2Q9Y5U4 225 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 WSB1Q9Y6I7 421 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 CCDC168Q8NDH2 2452 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 A0A0J9YWU9 116 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 H0Y9J4 135 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 HRASP01112 189 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 REG1BP48304 166 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 AKR1C2P52895 323 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 RAB4BP61018 213 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 KLRD1Q13241 179 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 TTC32Q5I0X7 151 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF506Q5JVG8 444 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRC-214ENST00000530727 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 TEX43Q6ZNM6 134 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 ZNF767PQ75MW2 155 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 VMO1Q7Z5L0 202 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 NIT1Q86X76 327 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 PDPNQ86YL7 162 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 DYNAPQ8N1N2 210 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 OR13D1Q8NGV5 346 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 SMIM12Q96EX1 92 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRC-214ENST00000530727 BET1LQ9NYM9 111 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 NF1P21359 2839 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 ABCA1O95477 2261 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 A0A1B0GV72 72 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 A0A1B0GW64 132 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 RBFOX3A6NFN3 312 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 FAM24AA6NFZ4 105 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 UPK2O00526 184 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 SSSCA1O60232 199 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRC-214ENST00000530727 SLC25A16P16260 332 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRC-214ENST00000530727 EBI3Q14213 229 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRC-214ENST00000530727 UBAC2Q8NBM4 344 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 PHYHIPLQ96FC7 376 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 METTL26Q96S19 204 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 RNF5Q99942 180 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 DPM3Q9P2X0 92 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 WASHC3Q9Y3C0 194 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 TLN2Q9Y4G6 2542 aa3.04□□□□□ -1.92
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PTPRC-214ENST00000530727 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa3.04□□□□□ -1.92
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PTPRC-214ENST00000530727 OOSP1A8MZH6 123 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 E7EUB6 86 aa3.04□□□□□ -1.92
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PTPRC-214ENST00000530727 MED6O75586 246 aa3.04□□□□□ -1.92
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PTPRC-214ENST00000530727 VENTXO95231 258 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 SNAPINO95295 136 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 IFNA7P01567 189 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 APOA2P02652 100 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 CD99P14209 185 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 MDKP21741 143 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 IL3RAP26951 378 aa3.04□□□□□ -1.92
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PTPRC-214ENST00000530727 RAB13P51153 203 aa3.04□□□□□ -1.92
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PTPRC-214ENST00000530727 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 UBA52P62987 128 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 KIAA0087Q14695 138 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 DEFB113Q30KQ7 82 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 CLLU1Q5K131 121 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 C1orf195Q5TG92 126 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 MINOS1Q5TGZ0 78 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 GTSCR1Q86UQ5 136 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRC-214ENST00000530727 BAP18Q8IXM2 172 aa3.04□□□□□ -1.92
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