RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524318.3

SFTPC-211, Transcript of surfactant protein C, humanhuman

TSL 3

Gene SFTPC, Length 993 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPC-211ENST00000524318 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 OR1L4Q8NGR5 311 aa7.33□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.33□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 NUDT15Q9NV35 164 aa7.33□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 UQCC1Q9NVA1 299 aa7.33□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 WDR83OSQ9Y284 106 aa7.33□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.33□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.32□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 DNAH2Q9P225 4427 aa7.32□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 PKHD1P08F94 4074 aa7.32□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.32□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 S100A11P31949 105 aa7.32□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 RPL29P47914 159 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 CCL18P55774 89 aa7.32□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 CLINT1Q14677 625 aa7.32□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 GUK1Q16774 197 aa7.32□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.32□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.32□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 NDUFA13Q9P0J0 144 aa7.32□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.31□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 NPIPB6E9PJ23 425 aa7.31□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 J3KRW8 73 aa7.31□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 CT45A10P0DMU9 189 aa7.31□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 SULT1A1P50225 295 aa7.31□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 S100A10P60903 97 aa7.31□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 IL15RAQ13261 267 aa7.31□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 OR5I1Q13606 314 aa7.31□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 VWC2Q2TAL6 325 aa7.31□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 TMEM252Q8N6L7 170 aa7.31□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 RNF141Q8WVD5 230 aa7.31□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 PFDN5Q99471 154 aa7.31□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.31□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.31□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.31□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 IGSF23A1L1A6 192 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 GAGE12BA1L429 117 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 SNURFLB1AK76 121 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 ZNF253O75346 499 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 GAGE7O76087 117 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 RLN2P04090 185 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 GAGE12FP0CL80 117 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 GAGE12GP0CL81 117 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 GAGE12IP0CL82 117 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 LEPP41159 167 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 HBG1P69891 147 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 HBG2P69892 147 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 BAXQ07812 192 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 RAB32Q13637 225 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 ATP6V1FQ16864 119 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 SSX7Q7RTT5 188 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 STX12Q86Y82 276 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 ODF3Q96PU9 254 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 CCDC32Q9BV29 185 aa7.3□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 PKD1P98161 4303 aa7.29□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.29□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.29□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 M0R3E3 92 aa7.29□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 M6PRP20645 277 aa7.29□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 FGF7P21781 194 aa7.29□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 TNP2Q05952 138 aa7.29□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 ZNF575Q86XF7 245 aa7.29□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 C6orf223Q8N319 242 aa7.29□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.29□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.29□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 TMEM14CQ9P0S9 112 aa7.29□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.29□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 A0A0J9YY99 117 aa7.28□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 NDUFB4O95168 129 aa7.28□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 HOXA5P20719 270 aa7.28□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 ERCC8Q13216 396 aa7.28□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 MZT2BQ6NZ67 158 aa7.28□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 ZNF503Q96F45 646 aa7.28□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 LINC00477Q96M19 166 aa7.28□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 Q9H8V8 135 aa7.28□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 PRELID1Q9Y255 219 aa7.28□□□□□ -1.24
SFTPC-211ENST00000524318 C7orf71A4D174 169 aa7.27□□□□□ -1.25
SFTPC-211ENST00000524318 MPDU1O75352 247 aa7.27□□□□□ -1.25
SFTPC-211ENST00000524318 PYYP10082 97 aa7.27□□□□□ -1.25
SFTPC-211ENST00000524318 NHLH2Q02577 135 aa7.27□□□□□ -1.25
SFTPC-211ENST00000524318 PDE6HQ13956 83 aa7.27□□□□□ -1.25
SFTPC-211ENST00000524318 Q6ZTI0 123 aa7.27□□□□□ -1.25
SFTPC-211ENST00000524318 BLNKQ8WV28 456 aa7.27□□□□□ -1.25
SFTPC-211ENST00000524318 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa7.27□□□□□ -1.25
SFTPC-211ENST00000524318 H3BNG1 76 aa7.26□□□□□ -1.25
SFTPC-211ENST00000524318 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SFTPC-211ENST00000524318 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms