RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 KCNS1Q96KK3 526 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 NSMCE2Q96MF7 247 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPR82Q96P67 336 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 ATP5SQ99766 215 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 CIB1Q99828 191 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPXQ9BT56 116 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP1.03□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 C20orf27Q9GZN8 174 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 GFRA4Q9GZZ7 299 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 KCNK15Q9H427 330 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 COMMD9Q9P000 198 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSPB7Q9UBY9 170 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 AK3Q9UIJ7 227 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC45A2Q9UMX9 530 aa1.03□□□□□ -2.24
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRGV11A0A075B6L2 103 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 C20orf202A1L168 122 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC182A6NF36 153 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZFP92A6NM28 416 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 SNRPGP15A8MWD9 76 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 J3QLW9 94 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 NDUFAB1O14561 156 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF861PO60384 105 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 CIDEAO60543 219 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 DIRAS3O95661 229 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM107AO95990 144 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRASP01116 189 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 NPPAP01160 153 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGKV1-39P01597 117 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGKV1D-39P04432 117 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPX1P07203 203 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGLC1P0CG04 106 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 UBBP0CG47 229 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 MGST1P10620 155 aaKnown RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 FGF6P10767 208 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC25A4P12235 298 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 COX4I1P13073 169 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 OSMP13725 252 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF19P17023 458 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 F2RP25116 425 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 TALDO1P37837 337 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 PTTG1IPP53801 180 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 PIGPP57054 158 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPS20P60866 119 aaKnown RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 BAK1Q16611 211 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 POU2AF1Q16633 256 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 HIGD2BQ4VC39 106 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 AADACL3Q5VUY0 350 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 HACD4Q5VWC8 232 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 ETFRF1Q6IPR1 90 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 ARPINQ7Z6K5 226 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM252Q8N6L7 170 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 NANOGP1Q8N7R0 232 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR13C8Q8NGS7 320 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR51H1Q8NH63 302 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZFAND1Q8TCF1 268 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPR148Q8TDV2 347 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAB2BQ8WUD1 216 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 RASL10AQ92737 203 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 UFD1Q92890 307 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 ACY3Q96HD9 319 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 PYURFQ96I23 114 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 PGLYRP3Q96LB9 341 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 CARD19Q96LW7 228 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 LINC00477Q96M19 166 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 WFDC1Q9HC57 220 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 UQCC1Q9NVA1 299 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR2W1Q9Y3N9 320 aa1.02□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A0G2JRQ6 117 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 DAPL1A0PJW8 107 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANKRD65E5RJM6 399 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 GABARAPH6UMI1 98 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 M0R2P5 195 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 RHODO00212 210 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRASO14807 208 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC16A6O15403 523 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP5-8O75690 187 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 GABARAPO95166 117 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 P01737 135 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 CTXN2P0C2S0 81 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL7P18124 248 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 CXCL3P19876 107 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 G6PCP35575 357 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL28P46779 137 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAB5CP51148 216 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 GYS2P54840 703 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-548P-201ENST00000517083 GNG11P61952 73 aa1.01□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms