RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746		K7ERU9	68 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	SH2D1A	O60880	128 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	IGLC6	P0CF74	106 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	CT45A10	P0DMU9	189 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	SLURP1	P55000	103 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	SRSF2	Q01130	221 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	PSMG4	Q5JS54	123 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF491	Q8N8L2	437 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	OR4X2	Q8NGF9	303 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	PRELID3A	Q96N28	172 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	ASCL2	Q99929	193 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	RASL11B	Q9BPW5	248 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	CNFN	Q9BYD5	112 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	RAB1B	Q9H0U4	201 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	FBXL15	Q9H469	300 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746		Q9UFV3	132 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	INSIG2	Q9Y5U4	225 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	MAP1B	P46821	2468 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	SVIL	O95425	2214 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	ROS1	P08922	2347 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746		A1L4Q6	167 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM189	A5PLL7	270 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746		A6NDN8	102 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	GAGE10	A6NGK3	116 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	FBLL1	A6NHQ2	334 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746		E7EQL1	145 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746		G3V4G9	280 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746		H0Y8G0	127 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746		K7EQM0	130 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746		M0R3E3	92 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	SNAI2	O43623	268 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	NDUFS7	O75251	213 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	SAP30	O75446	220 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	IGHG4	P01861	327 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	HBD	P02042	147 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	APELA	P0DMC3	54 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	AMN1	Q8IY45	258 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	ORMDL3	Q8N138	153 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	BCL6B	Q8N143	479 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	DEFB124	Q8NES8	71 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	NPB	Q8NG41	125 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	OR8A1	Q8NGG7	326 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	CCL17	Q92583	94 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	RNF125	Q96EQ8	232 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	RNF185	Q96GF1	192 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	C8orf49	Q96NF6	230 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	VPS25	Q9BRG1	176 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	CSTL1	Q9H114	145 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	HEATR1	Q9H583	2144 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	THYN1	Q9P016	225 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	HIGD1B	Q9P298	99 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	RALY	Q9UKM9	306 aa	Known RBP	3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	ABCA1	O95477	2261 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	ICE1	Q9Y2F5	2266 aa		3.87	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	CEP250	Q9BV73	2442 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	TTC28	Q96AY4	2481 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A0G2JLM5	398 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A1W2PPM0	123 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	SMKR1	H3BMG3	65 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	NDUFA3	O95167	84 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	NPY	P01303	97 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	HLA-DRB4	P13762	266 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	UQCRFS1	P47985	274 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	DLX1	P56177	255 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	CACNG7	P62955	275 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	NHLH1	Q02575	133 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	ODF1	Q14990	250 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	GFRAL	Q6UXV0	394 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	PCP2	Q8IVA1	136 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	OR5A1	Q8NGJ0	315 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	CFHR4	Q92496	578 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	AJUBA	Q96IF1	538 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	PRR25	Q96S07	402 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	DKK2	Q9UBU2	259 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		3.86	□□□□□ -1.79
ATXN3-212	ENST00000515746	PLXNB1	O43157	2135 aa		3.86	□□□□□ -1.79

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