RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SIX6O95475 246 aa11.93□□□□□ -0.5
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 NHLH2Q02577 135 aa11.93□□□□□ -0.5
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF586Q9NXT0 402 aa11.92□□□□□ -0.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNAH6Q9C0G6 4158 aa11.92□□□□□ -0.5
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 DEFA3P59666 94 aa11.91□□□□□ -0.5
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 DEFB130AP0DP74 79 aa11.89□□□□□ -0.51
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 BATF3Q9NR55 127 aa11.89□□□□□ -0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NDUFB4O95168 129 aa11.88□□□□□ -0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CT45A10P0DMU9 189 aa11.88□□□□□ -0.51
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM88Q6PEY1 159 aa11.88□□□□□ -0.51
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa11.88□□□□□ -0.51
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa11.86□□□□□ -0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC00477Q96M19 166 aa11.86□□□□□ -0.51
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 AAMDCQ9H7C9 122 aa11.86□□□□□ -0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 M0R3E3 92 aa11.85□□□□□ -0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MPC2O95563 127 aa11.85□□□□□ -0.51
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NBEAP1P0C6P0 100 aa11.84□□□□□ -0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MIR17HGQ75NE6 70 aa11.84□□□□□ -0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BLNKQ8WV28 456 aa11.84□□□□□ -0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATP5SQ99766 215 aa11.84□□□□□ -0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PYGO2Q9BRQ0 406 aa11.84□□□□□ -0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OR51M1Q9H341 326 aa11.84□□□□□ -0.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NMBP08949 121 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC00612Q8N6U2 182 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM19A4Q96LR4 140 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FUT9Q9Y231 359 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSPB11Q9Y547 144 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KLLNB2CW77 178 aa11.82□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPL12P30050 165 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ERCC8Q13216 396 aa11.82□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC00467Q9BRT7 94 aa11.82□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PAXXQ9BUH6 204 aa11.82□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C7orf71A4D174 169 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SNURFLB1AK76 121 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 J3KRW8 73 aa11.81□□□□□ -0.52
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