RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 RASL11BQ9BPW5 248 aa5.37□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 K7EIM0 57 aa5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 NDUFB3O43676 98 aa5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 LY6HO94772 140 aa5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 EVI2AP22794 236 aa5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 FXYD2P54710 66 aa5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 MTURNQ8N3F0 131 aa5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF491Q8N8L2 437 aa5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 DEFB124Q8NES8 71 aa5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR1N2Q8NGR9 330 aa5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF414Q96IQ9 312 aa5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRELID3AQ96N28 172 aa5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 G3V4G9 280 aa5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 C16orf97H3BN30 126 aa5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 VGLL1Q99990 258 aa5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 NDUFS7O75251 213 aa5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 PLP1P60201 277 aa5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM155Q4W5P6 130 aa5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 K7ERU9 68 aa5.35□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP5.35□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 SH2D1AO60880 128 aa5.35□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 CSN1S1P47710 185 aa5.35□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 RIGQ13278 110 aa5.35□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM162BQ5T6X4 162 aa5.35□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM104BQ5XKR9 115 aa5.35□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 SMIM15Q7Z3B0 74 aa5.35□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A0G2JNJ9 132 aa5.35□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 A1L4Q6 167 aa5.35□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 K7EP34 96 aa5.35□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPRY2O43597 315 aa5.35□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 TWIST1Q15672 202 aa5.35□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 OR2K2Q8NGT1 345 aa5.35□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa5.35□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 Q9UFV3 132 aa5.35□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 H3BRM9 83 aa5.35□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGLV1-47P01700 117 aa5.35□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGHG4P01861 327 aa5.35□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 LGALS7P47929 136 aa5.35□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 PLGLAQ15195 96 aa5.35□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 LCNL1Q6ZST4 164 aa5.35□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 HHLA3Q9XRX5 114 aa5.35□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM265A0A087WTH1 108 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 CNIH1O95406 144 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 ERCC8Q13216 396 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 CLEC2AQ6UVW9 174 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 GTSCR1Q86UQ5 136 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 LINC00311Q8N616 119 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 IFI27L1Q96BM0 104 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM14CQ9P0S9 112 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 SPCS1Q9Y6A9 102 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 AGRNO00468 2067 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 A0A1W2PPM0 123 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 H3BRN7 92 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 GCSHP23434 173 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 MC5RP33032 325 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 CKS2P33552 79 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 RPS20P60866 119 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 SEC11AP67812 179 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 PAX2Q02962 417 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 RBPJQ06330 500 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 C1orf185Q5T7R7 199 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF493Q6ZR52 646 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 NEGR1Q7Z3B1 354 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 RNF125Q96EQ8 232 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 U3KQK5 164 aa5.34□□□□□ -1.55
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa5.34□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa5.34□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM189A5PLL7 270 aa5.34□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRAC2D3DTV9 90 aa5.34□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 F8W735 103 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 GNG7O60262 68 aa5.34□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF562Q6V9R5 426 aa5.34□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 ORMDL3Q8N138 153 aa5.34□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 DEFB123Q8N688 67 aa5.34□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 RNF185Q96GF1 192 aa5.34□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa5.34□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 AKAP6Q13023 2319 aa5.33□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa5.33□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa5.33□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa5.33□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 TIMM23O14925 209 aa5.33□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 LGALS9BQ3B8N2 356 aa5.33□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 LGALS9CQ6DKI2 356 aa5.33□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM108Q6UXF1 575 aa5.33□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 GFRALQ6UXV0 394 aa5.33□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa5.33□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 AP1S3Q96PC3 154 aa5.33□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa5.33□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 HBDP02042 147 aa5.33□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 FTH1P19P0C7X4 201 aa5.33□□□□□ -1.56
RAPGEF6-211ENST00000512611 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
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