RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506932.1

SH3BP2-211, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP2, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-211ENST00000506932 POM121L12Q8N7R1 296 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 PFDN5Q99471 154 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 NPCDR1Q9BY65 106 aa11.08□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 P0DMU3 169 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 FAM231AP0DMU4 169 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 FAM231CP0DMU5 169 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 DEFB130BP0DP73 79 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 DEFB130AP0DP74 79 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 PYYP10082 97 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 TSPOP30536 169 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 H2BFSP57053 126 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 GFI1BQ5VTD9 330 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 OR5C1Q8NGR4 320 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 CHAC2Q8WUX2 184 aa11.07□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 J3KRW8 73 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 M0R3E3 92 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 CLINT1Q14677 625 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 ATP6V1FQ16864 119 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 OR10J6PQ8NGY7 276 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 NMES1Q9C002 83 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 DNAH2Q9P225 4427 aa11.06□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 TRBV19A0A075B6N1 114 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 LYRM9A8MSI8 78 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 E5RGE8 158 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 M0R2N4 97 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 PRAF2O60831 178 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 NDUFB4O95168 129 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 CT45A10P0DMU9 189 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 TAS2R60P59551 318 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 GUK1Q16774 197 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 TMEM256Q8N2U0 113 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 FAM210BQ96KR6 192 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 MARVELD1Q9BSK0 173 aa11.05□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 NACAE9PAV3 2078 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 NPIPB6E9PJ23 425 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 MIR17HGQ75NE6 70 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 SLC25A2Q9BXI2 301 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 TMEM14CQ9P0S9 112 aa11.04□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 ZNF253O75346 499 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 MPDU1O75352 247 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 ERCC8Q13216 396 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 BLNKQ8WV28 456 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 C16orf74Q96GX8 76 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 SLC25A31Q9H0C2 315 aa11.03□□□□□ -0.64
SH3BP2-211ENST00000506932 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 H7BYZ3 331 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 SSNA1O43805 119 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 RLN2P04090 185 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 FAT2Q9NYQ8 4349 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 F5H768 121 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 TIMM9Q9Y5J7 89 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 DNAH17Q9UFH2 4485 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 RTL8CO15255 209 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 MPC2O95563 127 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 ATP5G1P05496 136 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 LEPP41159 167 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 ATP5G3P48201 142 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 DEFA1P59665 94 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 DEFA3P59666 94 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 CYCSP99999 105 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 ODF3Q96PU9 254 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 C20orf144Q9BQM9 153 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 SMIM3Q9BZL3 60 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 OR10J4P0C629 311 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 PDE6HQ13956 83 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 ICAM4Q14773 271 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 FAM122CQ6P4D5 195 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 ZNF493Q6ZR52 646 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 FXYD5Q96DB9 178 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 ATP5SQ99766 215 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 MBD2Q9UBB5 411 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 HSPB11Q9Y547 144 aa10.99□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 CBY3A6NI87 242 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 CD300CQ08708 224 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 BTN1A1Q13410 526 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 RNF212Q495C1 297 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 Q6ZR54 194 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 ZNF503Q96F45 646 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 PHYHIPLQ96FC7 376 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 FAM19A4Q96LR4 140 aa10.98□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 NUDT3O95989 172 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 LGALS9BQ3B8N2 356 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 PRR9Q5T870 116 aa10.97□□□□□ -0.65
SH3BP2-211ENST00000506932 Q6ZQT7 251 aa10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms