RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494396.5

SYP-208, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 2,062 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-208ENST00000494396 ORMDL3Q8N138 153 aa13.12□□□□□ -0.31
SYP-208ENST00000494396 ZNF414Q96IQ9 312 aa13.12□□□□□ -0.31
SYP-208ENST00000494396 A0A096LNJ9 63 aa13.11□□□□□ -0.31
SYP-208ENST00000494396 A0A1W2PPI3 338 aa13.11□□□□□ -0.31
SYP-208ENST00000494396 J3QR89 54 aa13.11□□□□□ -0.31
SYP-208ENST00000494396 PRNTQ86SH4 94 aa13.11□□□□□ -0.31
SYP-208ENST00000494396 DTX2Q86UW9 622 aa13.11□□□□□ -0.31
SYP-208ENST00000494396 OR8A1Q8NGG7 326 aa13.11□□□□□ -0.31
SYP-208ENST00000494396 THYN1Q9P016 225 aa13.11□□□□□ -0.31
SYP-208ENST00000494396 C19orf84I3L1E1 186 aa13.11□□□□□ -0.31
SYP-208ENST00000494396 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa13.11□□□□□ -0.31
SYP-208ENST00000494396 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa13.11□□□□□ -0.31
SYP-208ENST00000494396 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa13.11□□□□□ -0.31
SYP-208ENST00000494396 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa13.1□□□□□ -0.31
SYP-208ENST00000494396 S100A7P31151 101 aa13.1□□□□□ -0.31
SYP-208ENST00000494396 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SYP-208ENST00000494396 SAMD5Q5TGI4 173 aa13.1□□□□□ -0.31
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SYP-208ENST00000494396 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
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SYP-208ENST00000494396 S100A7AQ86SG5 101 aa13.09□□□□□ -0.31
SYP-208ENST00000494396 PIP4P2Q8N4L2 257 aa13.09□□□□□ -0.31
SYP-208ENST00000494396 IFI27L1Q96BM0 104 aa13.09□□□□□ -0.31
SYP-208ENST00000494396 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa13.09□□□□□ -0.31
SYP-208ENST00000494396 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SYP-208ENST00000494396 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa13.09□□□□□ -0.31
SYP-208ENST00000494396 A0A1W2PPR1 153 aa13.09□□□□□ -0.31
SYP-208ENST00000494396 DLX6P56179 175 aa13.09□□□□□ -0.31
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SYP-208ENST00000494396 TMEM155Q4W5P6 130 aa13.08□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP13.08□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 C10orf55Q5SWW7 151 aa13.08□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 TIMD4Q96H15 378 aa13.08□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 UBTD1Q9HAC8 227 aa13.08□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 SMPXQ9UHP9 88 aa13.08□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 TRBV19A0A075B6N1 114 aa13.07□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa13.07□□□□□ -0.32
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SYP-208ENST00000494396 SIGMAR1Q99720 223 aa13.07□□□□□ -0.32
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SYP-208ENST00000494396 D6R8Y8 96 aa13.06□□□□□ -0.32
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SYP-208ENST00000494396 IGHV1-8P0DP01 117 aa13.04□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 FOXI2Q6ZQN5 318 aa13.04□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa13.04□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 ZMAT4Q9H898 229 aa13.04□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 LYZP61626 148 aa13.04□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 TAL2Q16559 108 aa13.04□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa13.04□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa13.04□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 RAB37Q96AX2 223 aa13.04□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 RASL11BQ9BPW5 248 aa13.04□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
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SYP-208ENST00000494396 NMUP48645 174 aa13.03□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa13.03□□□□□ -0.32
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SYP-208ENST00000494396 TM2D2Q9BX73 214 aa13.03□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 NDUFS7O75251 213 aa13.03□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 RPL24P83731 157 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa13.03□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 HCP5Q6MZN7 132 aa13.03□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 TMEM133Q9H2Q1 129 aa13.03□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa13.02□□□□□ -0.32
SYP-208ENST00000494396 GOSR1O95249 250 aa13.02□□□□□ -0.33
SYP-208ENST00000494396 FAM106CPP0CH98 169 aa13.02□□□□□ -0.33
SYP-208ENST00000494396 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
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