RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493814.1

C1orf43-209, Transcript of chromosome 1 open reading frame 43, humanhuman

TSL 2

Gene C1orf43, Length 441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf43-209ENST00000493814 NHLH2Q02577 135 aa6.49□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 OR5C1Q8NGR4 320 aa6.49□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.49□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.49□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 BATF3Q9NR55 127 aa6.49□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 OR5AC2Q9NZP5 309 aa6.49□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 NACAE9PAV3 2078 aa6.49□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 LYRM9A8MSI8 78 aa6.48□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 SSNA1O43805 119 aa6.48□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 PRM2P04554 102 aa6.48□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 HTN3P15516 51 aa6.48□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 TSPOP30536 169 aa6.48□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 THAP6Q8TBB0 222 aa6.48□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 FAM210BQ96KR6 192 aa6.48□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 LINC01587Q99440 93 aa6.48□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.48□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.48□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa6.48□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 PRAC2D3DTV9 90 aa6.47□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 H0YIZ8 118 aa6.47□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 ZNF253O75346 499 aa6.47□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 PET100P0DJ07 73 aa6.47□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 AZU1P20160 251 aa6.47□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 H2BFSP57053 126 aa6.47□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 CLINT1Q14677 625 aa6.47□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.47□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 C16orf74Q96GX8 76 aa6.47□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 KCNIP2Q9NS61 270 aa6.47□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 TMEM14CQ9P0S9 112 aa6.47□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 TIMM9Q9Y5J7 89 aa6.47□□□□□ -1.37
C1orf43-209ENST00000493814 TRBV19A0A075B6N1 114 aa6.46□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 C17orf112F2Z3M2 114 aa6.46□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 H7BYZ3 331 aa6.46□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 MPC2O95563 127 aa6.46□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 PYYP10082 97 aa6.46□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 HTN1P15515 57 aa6.46□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 LEPP41159 167 aa6.46□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 TAS2R60P59551 318 aa6.46□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 PDE6HQ13956 83 aa6.46□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.46□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.46□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.46□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 ODF3Q96PU9 254 aa6.46□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 PRELID1Q9Y255 219 aa6.46□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 DNAH2Q9P225 4427 aa6.45□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.45□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.45□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.45□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.45□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 J3KRW8 73 aa6.45□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 M0R3E3 92 aa6.45□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 DEFB130BP0DP73 79 aa6.45□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 DEFB130AP0DP74 79 aa6.45□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 KIR3DS1Q14943 382 aa6.45□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.45□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 TMEM88Q6PEY1 159 aa6.45□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.45□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 MIR17HGQ75NE6 70 aa6.45□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 BLNKQ8WV28 456 aa6.45□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 ATP5SQ99766 215 aa6.45□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 SLC25A2Q9BXI2 301 aa6.45□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 AAMDCQ9H7C9 122 aa6.45□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 HSPB11Q9Y547 144 aa6.45□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.44□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 NDUFB4O95168 129 aa6.44□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 ATP5G1P05496 136 aa6.44□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 CT45A10P0DMU9 189 aa6.44□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 RPL12P30050 165 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 ATP5G3P48201 142 aa6.44□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 FCN2Q15485 313 aa6.44□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.44□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 C15orf53Q8NAA6 179 aa6.44□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa6.44□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 OR51M1Q9H341 326 aa6.44□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 FUT9Q9Y231 359 aa6.44□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 CBY3A6NI87 242 aa6.43□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 SNURFLB1AK76 121 aa6.43□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 IFNA5P01569 189 aa6.43□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 NBEAP1P0C6P0 100 aa6.43□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 ERCC8Q13216 396 aa6.43□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 ICAM4Q14773 271 aa6.43□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 FFAR4Q5NUL3 377 aa6.43□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.43□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 SCGB1C1Q8TD33 95 aa6.43□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 LINC00477Q96M19 166 aa6.43□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 PYGO2Q9BRQ0 406 aa6.43□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 PAXXQ9BUH6 204 aa6.43□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 SMIM3Q9BZL3 60 aa6.43□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
C1orf43-209ENST00000493814 MBD2Q9UBB5 411 aa6.43□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms