RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa10.08□□□□□ -0.8
PRAME-213ENST00000492657 Q86TA4 180 aa10.08□□□□□ -0.8
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PRAME-213ENST00000492657 BPESC1Q9GZL8 116 aa10.08□□□□□ -0.8
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PRAME-213ENST00000492657 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 FXYD7P58549 80 aa10□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 FAM208BQ5VWN6 2430 aa9.99□□□□□ -0.81
PRAME-213ENST00000492657 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa9.99□□□□□ -0.81
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