RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489453.1

CHKB-211, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 722 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-211ENST00000489453 KIR3DS1Q14943 382 aa7.18□□□□□ -1.26
CHKB-211ENST00000489453 C10orf113Q5VZT2 155 aa7.18□□□□□ -1.26
CHKB-211ENST00000489453 PATE2Q6UY27 113 aa7.18□□□□□ -1.26
CHKB-211ENST00000489453 PYGO2Q9BRQ0 406 aa7.18□□□□□ -1.26
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CHKB-211ENST00000489453 H3BMQ9 156 aa7.17□□□□□ -1.26
CHKB-211ENST00000489453 SLC17A3O00476 420 aa7.17□□□□□ -1.26
CHKB-211ENST00000489453 AGPAT2O15120 278 aa7.17□□□□□ -1.26
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CHKB-211ENST00000489453 TSC22D2O75157 780 aa7.17□□□□□ -1.26
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CHKB-211ENST00000489453 RGS13O14921 159 aa7.13□□□□□ -1.27
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CHKB-211ENST00000489453 MORN5Q5VZ52 161 aa7.13□□□□□ -1.27
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CHKB-211ENST00000489453 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
CHKB-211ENST00000489453 TIMM9Q9Y5J7 89 aa7.13□□□□□ -1.27
CHKB-211ENST00000489453 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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CHKB-211ENST00000489453 ZNF253O75346 499 aa7.12□□□□□ -1.27
CHKB-211ENST00000489453 MPDU1O75352 247 aa7.12□□□□□ -1.27
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CHKB-211ENST00000489453 ERCC8Q13216 396 aa7.12□□□□□ -1.27
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CHKB-211ENST00000489453 BTN1A1Q13410 526 aa7.12□□□□□ -1.27
CHKB-211ENST00000489453 MIC13Q5XKP0 118 aa7.12□□□□□ -1.27
CHKB-211ENST00000489453 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
CHKB-211ENST00000489453 LYPD1Q8N2G4 141 aa7.12□□□□□ -1.27
CHKB-211ENST00000489453 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CHKB-211ENST00000489453 LINC00477Q96M19 166 aa7.12□□□□□ -1.27
CHKB-211ENST00000489453 C18orf15Q96N68 181 aa7.12□□□□□ -1.27
CHKB-211ENST00000489453 ARPC5LQ9BPX5 153 aa7.12□□□□□ -1.27
CHKB-211ENST00000489453 PRELID1Q9Y255 219 aa7.12□□□□□ -1.27
CHKB-211ENST00000489453 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
CHKB-211ENST00000489453 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.12□□□□□ -1.27
CHKB-211ENST00000489453 C7orf66A4D0T2 115 aa7.11□□□□□ -1.27
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