RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486679.2

MYCBP2-208, Transcript of MYC binding protein 2, E3 ubiquitin protein ligase, human

TSL 3

Gene MYCBP2, Length 545 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	CACNG8	Q8WXS5	425 aa		4.01	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	VGLL1	Q99990	258 aa		4.01	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		4.01	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	ESM1	Q9NQ30	184 aa		4.01	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF71	Q9NQZ8	489 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.01	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	CFAP54	Q96N23	3096 aa		4.01	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	OTOGL	Q3ZCN5	2332 aa		4.01	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	IGHV3-15	A0A0B4J1V0	119 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	IGHV1-24	A0A0C4DH33	117 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679		F2Z2F3	143 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	BORCS8-MEF2B	H3BNR1	382 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	KLRC4-KLRK1	H3BQV0	150 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679		H3BUT2	72 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679		P04436	131 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	G6PC	P35575	357 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	SLA	Q13239	276 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	KLRD1	Q13241	179 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	DMRTC1	Q5HYR2	192 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	LCN12	Q6JVE5	192 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679		Q6P435	159 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	AAED1	Q7RTV5	226 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	S100A7A	Q86SG5	101 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	ATOH7	Q8N100	152 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679		Q8N7P7	452 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	GATD1	Q8NB37	220 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	NUP35	Q8NFH5	326 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	FMC1	Q96HJ9	113 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	IGF2BP2-AS1	Q96M15	143 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	GPR82	Q96P67	336 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	MGST2	Q99735	147 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	RPP21	Q9H633	154 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	THYN1	Q9P016	225 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	PRND	Q9UKY0	176 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	BOK	Q9UMX3	212 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	MUC3A	Q02505	3323 aa		4	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	HIGD1C	A8MV81	97 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	LINC01619	G3V211	115 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679		K7EQD1	137 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	CXCL13	O43927	109 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	TSPAN13	O95857	204 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679		P01737	135 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	CRYGC	P07315	174 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	S100A7	P31151	101 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	CRYBA4	P53673	196 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	HSPE1	P61604	102 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	MIC13	Q5XKP0	118 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	SSX8	Q7RTT4	187 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	DOLPP1	Q86YN1	238 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	MDS2	Q8NDY4	140 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	OR10D3	Q8NH80	312 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	LRRC29	Q8WV35	223 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF714	Q96N38	554 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	NABP2	Q9BQ15	211 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	RNASE7	Q9H1E1	156 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	CLEC5A	Q9NY25	188 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	JPT1	Q9UK76	154 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	KLF12	Q9Y4X4	402 aa		3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	KNTC1	P50748	2209 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	INS-IGF2	F8WCM5	200 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679		H3BMG7	143 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	PEX7	O00628	323 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	SYNGR1	O43759	233 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	IGHV3-7	P01780	117 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	RPL8	P62917	257 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	POU2AF1	Q16633	256 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	HES3	Q5TGS1	186 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	SPINK14	Q6IE38	97 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	OR1L8	Q8NGR8	309 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	GTSF1	Q8WW33	167 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	ARPC1A	Q92747	370 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	CYYR1	Q96J86	154 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	HES7	Q9BYE0	225 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	ERG28	Q9UKR5	140 aa		3.98	□□□□□ -1.77
MYCBP2-208	ENST00000486679	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77

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