RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 FANCD2OSQ96PS1 177 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 KLK15Q9H2R5 256 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.46□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 F2Z2F3 143 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 M0R2Z0 102 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 INSP01308 110 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 IGHG4P01861 327 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 Q8TAT8 98 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 SMIM12Q96EX1 92 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 LINC01551Q86U37 167 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM158Q8WZ71 300 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 EMP1P54849 157 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 PLP1P60201 277 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 CACNG7P62955 275 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF726P1Q15940 193 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 AP1S3Q96PC3 154 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 DERL1Q9BUN8 251 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 TNCP24821 2201 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 TRGC2P03986 189 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 GPHB5Q86YW7 130 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 TSKUQ8WUA8 353 aa6.45□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 PRSS1P07477 247 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 OR5AL1P0C617 328 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 MYCNOSP40205 109 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 PMS2P11Q13670 270 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 RNF182Q8N6D2 247 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 OR9G4Q8NGQ1 327 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 DIRC3C9JPN6 131 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 K7EMT4 169 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 Q86TA4 180 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 Q8N6K4 173 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 FXYD5Q96DB9 178 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 NUDT11Q96G61 164 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 SLURP1P55000 103 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 DEFB121Q5J5C9 76 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 Q6ZN92 141 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 KIR2DL4Q99706 377 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 SZT2Q5T011 3432 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 A0A087WW49 117 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 LINC01548A6NM66 108 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 AVPP01185 164 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 CBLN1P23435 193 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 C9orf66Q5T8R8 295 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM242Q9NWH2 141 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 GGTLC3B5MD39 225 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 SRIP30626 198 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 IMMP2LQ96T52 175 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 TMEM136Q6ZRR5 245 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 REC114Q7Z4M0 266 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 BPTFQ12830 3046 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF415Q09FC8 603 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 ERCC8Q13216 396 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 UBE2L6O14933 153 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 BUB3O43684 328 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 SH2D1AO60880 128 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 HILS1P60008 231 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 KIAA1644Q3SXP7 199 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 Q6ZSV7 163 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 LINC00479Q96M42 142 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 H3BVH4 76 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 ELOBQ15370 118 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 POLQO75417 2590 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRD-211ENST00000486161 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.41□□□□□ -1.38
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