RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 CYSLTR1Q9Y271 337 aa-1.45□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 LY96Q9Y6Y9 160 aa-1.45□□□□□ -2.64
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SHQ1-204ENST00000468347 IFT172Q9UG01 1749 aa-1.46□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 KDM3BQ7LBC6 1761 aa-1.46□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 TRAV17A0A0B4J275 112 aa-1.46□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa-1.46□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa-1.46□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 WBP4O75554 376 aaKnown RBP-1.46□□□□□ -2.64
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SHQ1-204ENST00000468347 UGT2B7P16662 529 aa-1.46□□□□□ -2.64
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SHQ1-204ENST00000468347 SDF2Q99470 211 aa-1.46□□□□□ -2.64
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SHQ1-204ENST00000468347 REV3LO60673 3130 aa-1.46□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 KIAA0232Q92628 1395 aa-1.47□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 ROBO3Q96MS0 1386 aa-1.47□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 NCOA1Q15788 1441 aa-1.47□□□□□ -2.64
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SHQ1-204ENST00000468347 hDV103S1A0JD37 113 aa-1.47□□□□□ -2.64
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SHQ1-204ENST00000468347 VBP1P61758 197 aa-1.47□□□□□ -2.64
SHQ1-204ENST00000468347 VMA21Q3ZAQ7 101 aa-1.47□□□□□ -2.64
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SHQ1-204ENST00000468347 A8MWV9 139 aa-1.48□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 FAM25EA8MYX2 175 aa-1.48□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa-1.48□□□□□ -2.65
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SHQ1-204ENST00000468347 SNX4O95219 450 aa-1.48□□□□□ -2.65
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SHQ1-204ENST00000468347 MT1XP80297 61 aa-1.48□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 DCDP81605 110 aaKnown RBP-1.48□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 FADDQ13158 208 aa-1.48□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 TMED1Q13445 227 aa-1.48□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 INSL4Q14641 139 aa-1.48□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP-1.48□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 IMPG1Q17R60 797 aa-1.48□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 DNAL1Q4LDG9 190 aa-1.48□□□□□ -2.65
SHQ1-204ENST00000468347 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa-1.48□□□□□ -2.65
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