RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 SLC39A9Q9NUM3 307 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRF-210ENST00000463041 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
PTPRF-210ENST00000463041 TRAV5A0A0B4J249 113 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 IGSF23A1L1A6 192 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 E5RGE8 158 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 H7BYZ3 331 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 PRAF2O60831 178 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 DEFB130BP0DP73 79 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 DEFB130AP0DP74 79 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 BAXQ07812 192 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 MORN5Q5VZ52 161 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 CCDC28AQ8IWP9 274 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 ENKURQ8TC29 256 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 C16orf74Q96GX8 76 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 ODF3Q96PU9 254 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 NMES1Q9C002 83 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF586Q9NXT0 402 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM14CQ9P0S9 112 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 PRELID1Q9Y255 219 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 MUC4Q99102 2169 aa5.15□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 TRBV19A0A075B6N1 114 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 PLAC8L1A1L4L8 177 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 PRAC2D3DTV9 90 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 H3BTX0 84 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 ATP5G1P05496 136 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 HTN1P15515 57 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 FGF7P21781 194 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 ATP5G3P48201 142 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 NHLH2Q02577 135 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 PDE6HQ13956 83 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 FCN2Q15485 313 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM88Q6PEY1 159 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 LINC00477Q96M19 166 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 MARVELD1Q9BSK0 173 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 TIMM9Q9Y5J7 89 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 PKHD1P08F94 4074 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 NPIPB6E9PJ23 425 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 F5H768 121 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 M0R2N4 97 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 SLC17A3O00476 420 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 SIX6O95475 246 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 CT45A10P0DMU9 189 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 LEPP41159 167 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 IFITM3Q01628 133 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 OR5C1Q8NGR4 320 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 PYGO2Q9BRQ0 406 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 NPCDR1Q9BY65 106 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 PTTG2Q9NZH5 202 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 PKD1P98161 4303 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 H0YIZ8 118 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 NDUFB4O95168 129 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 NMBP08949 121 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 NBEAP1P0C6P0 100 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 DEFA1P59665 94 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 DEFA3P59666 94 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 KIR3DS1Q14943 382 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 SOHLH1Q5JUK2 328 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 GFI1BQ5VTD9 330 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 Q6ZR54 194 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 ATG101Q9BSB4 218 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 OR51M1Q9H341 326 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 AAMDCQ9H7C9 122 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 KCNIP2Q9NS61 270 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 HERC2O95714 4834 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 SNURFLB1AK76 121 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 C17orf112F2Z3M2 114 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 M0R3E3 92 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 RTL8CO15255 209 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 NUDT3O95989 172 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 PYYP10082 97 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 CCL18P55774 89 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 MIR17HGQ75NE6 70 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 LINC00612Q8N6U2 182 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 THAP6Q8TBB0 222 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 BLNKQ8WV28 456 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 RNF141Q8WVD5 230 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 FAM19A4Q96LR4 140 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRF-210ENST00000463041 LINC00467Q9BRT7 94 aa5.11□□□□□ -1.59
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