RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 IGFL4Q6B9Z1 124 aa7.01□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM24BQ8N5W8 94 aa7.01□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 RNF182Q8N6D2 247 aa7.01□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.01□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM210AQ96ND0 272 aa7.01□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 MAP6D1Q9H9H5 199 aa7.01□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 ANK2Q01484 3957 aa7.01□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa7□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 GGTLC3B5MD39 225 aa7□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 K7EQM0 130 aa7□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 PDE6DO43924 150 aa7□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 CD7P09564 240 aa7□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 HLA-DMBP28068 263 aa7□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 PEA15Q15121 130 aa7□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF506Q5JVG8 444 aa7□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 EBLN2Q6P2I7 272 aa7□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 FOXI2Q6ZQN5 318 aa7□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 HIST1H2BAQ96A08 127 aa7□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 C20orf173Q96LM9 149 aa7□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 EPDR1Q9UM22 224 aa7□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 RAB19A4D1S5 217 aa6.99□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 RBAKDNA6NC62 111 aa6.99□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 DIRC3C9JPN6 131 aa6.99□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 M0R3E3 92 aa6.99□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP5G3P48201 142 aa6.99□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 KRTAP10-11P60412 298 aa6.99□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.99□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 TOR2AQ5JU69 321 aa6.99□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.99□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 ATG101Q9BSB4 218 aa6.99□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 SMDT1Q9H4I9 107 aa6.99□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.99□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 MED9Q9NWA0 146 aa6.99□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.99□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 PEX7O00628 323 aa6.98□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 TCRAP04437 139 aa6.98□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.98□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.98□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 PRR25Q96S07 402 aa6.98□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 RARRES2Q99969 163 aa6.98□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.98□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 A0A0J9YX75 114 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00862A6NCI5 91 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 KNCNA6PVL3 124 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM250H0YL14 139 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 S100A9P06702 114 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 HLA-DRB4P13762 266 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 AKR1C3P42330 323 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 CNN1P51911 297 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 GNG5P63218 68 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 ACTL10Q5JWF8 245 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 APRG1Q8IVJ8 170 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 STHQ8IWL8 128 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 Q8N1Y9 231 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 C11orf52Q96A22 123 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 LINC00477Q96M19 166 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 SCO2A0A1W2PP80 73 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 PRAC2D3DTV9 90 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 F6UB75 175 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 H3BMM0 161 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 UBE2G1P62253 170 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM78Q5T7P6 136 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 UQCC3Q6UW78 93 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 DEFB125Q8N687 156 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM75Q8N9X5 138 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 FMC1Q96HJ9 113 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 TUBA4BQ9H853 241 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.96□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 TAS2R60P59551 318 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 DEFB1P60022 68 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 ERCC8Q13216 396 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF124Q15973 351 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM183BQ1AE95 376 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 GDF5OSQ5U4N7 250 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 COMMD7Q86VX2 200 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SH3BP4-208ENST00000462602 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms