RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 Q8TAT8 98 aa15.95■□□□□ 0.14
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IMP4-208ENST00000460766 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
IMP4-208ENST00000460766 AP5S1Q9NUS5 200 aa15.94■□□□□ 0.14
IMP4-208ENST00000460766 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
IMP4-208ENST00000460766 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa15.94■□□□□ 0.14
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IMP4-208ENST00000460766 MUC21A0A140T8X8 626 aa15.94■□□□□ 0.14
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IMP4-208ENST00000460766 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
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IMP4-208ENST00000460766 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
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IMP4-208ENST00000460766 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa15.9■□□□□ 0.14
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IMP4-208ENST00000460766 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
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IMP4-208ENST00000460766 PRELID3AQ96N28 172 aa15.87■□□□□ 0.13
IMP4-208ENST00000460766 LINC01548A6NM66 108 aa15.86■□□□□ 0.13
IMP4-208ENST00000460766 TWIST1Q15672 202 aa15.86■□□□□ 0.13
IMP4-208ENST00000460766 CLEC19AQ6UXS0 136 aa15.86■□□□□ 0.13
IMP4-208ENST00000460766 ORMDL3Q8N138 153 aa15.86■□□□□ 0.13
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IMP4-208ENST00000460766 ZFAND3Q9H8U3 227 aa15.86■□□□□ 0.13
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IMP4-208ENST00000460766 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa15.85■□□□□ 0.13
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IMP4-208ENST00000460766 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
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IMP4-208ENST00000460766 BUB3O43684 328 aa15.85■□□□□ 0.13
IMP4-208ENST00000460766 RPS20P60866 119 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
IMP4-208ENST00000460766 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
IMP4-208ENST00000460766 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15.85■□□□□ 0.13
IMP4-208ENST00000460766 PRAC2D3DTV9 90 aa15.84■□□□□ 0.13
IMP4-208ENST00000460766 LINC01545Q5VT33 79 aa15.84■□□□□ 0.13
IMP4-208ENST00000460766 CCDC140Q96MF4 163 aa15.84■□□□□ 0.13
IMP4-208ENST00000460766 U3KQK5 164 aa15.84■□□□□ 0.13
IMP4-208ENST00000460766 NPFFO15130 113 aa15.84■□□□□ 0.13
IMP4-208ENST00000460766 SLC25A34Q6PIV7 304 aa15.84■□□□□ 0.13
IMP4-208ENST00000460766 Q6ZVH6 145 aa15.84■□□□□ 0.13
IMP4-208ENST00000460766 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa15.83■□□□□ 0.12
IMP4-208ENST00000460766 NCR2O95944 276 aa15.83■□□□□ 0.12
IMP4-208ENST00000460766 RAB9AP51151 201 aa15.83■□□□□ 0.12
IMP4-208ENST00000460766 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa15.82■□□□□ 0.12
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