RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NDUFAF3Q9BU61 184 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NPCDR1Q9BY65 106 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NMES1Q9C002 83 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAT2Q9NYQ8 4349 aa10.23□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PYYP10082 97 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 OXA1LQ15070 435 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 OR5C1Q8NGR4 320 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRAF2O60831 178 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NDUFB4O95168 129 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DAD1P61803 113 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CLINT1Q14677 625 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ATP6V1FQ16864 119 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PFDN5Q99471 154 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RNF24Q9Y225 148 aa10.22□□□□□ -0.77
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 E5RGE8 158 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 M0R3E3 92 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CDKN1BP46527 198 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LINC01587Q99440 93 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLC25A2Q9BXI2 301 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa10.21□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CT45A10P0DMU9 189 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TSPOP30536 169 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GFI1BQ5VTD9 330 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMEM88Q6PEY1 159 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MIR17HGQ75NE6 70 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa10.2□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRBV19A0A075B6N1 114 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NPIPB6E9PJ23 425 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 J3KRW8 73 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HTN1P15515 57 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ERCC8Q13216 396 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 POM121L12Q8N7R1 296 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMEM14CQ9P0S9 112 aa10.19□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LYRM9A8MSI8 78 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MPDU1O75352 247 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DEFB130BP0DP73 79 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DEFB130AP0DP74 79 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TAS2R60P59551 318 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GUK1Q16774 197 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMEM256Q8N2U0 113 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 OR10J6PQ8NGY7 276 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SLC25A31Q9H0C2 315 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF253O75346 499 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RLN2P04090 185 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 P0DMU3 169 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM231AP0DMU4 169 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM231CP0DMU5 169 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BLNKQ8WV28 456 aa10.18□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MPC2O95563 127 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM210BQ96KR6 192 aa10.17□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 M0R2N4 97 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SSNA1O43805 119 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C16orf74Q96GX8 76 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SMIM3Q9BZL3 60 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MBD2Q9UBB5 411 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HSPB11Q9Y547 144 aa10.16□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DEFA1P59665 94 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DEFA3P59666 94 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CYCSP99999 105 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF503Q96F45 646 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ODF3Q96PU9 254 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ATP5SQ99766 215 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 WFDC1Q9HC57 220 aa10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 H7BYZ3 331 aa10.15□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FXYD5Q96DB9 178 aa10.15□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PHYHIPLQ96FC7 376 aa10.15□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM19A4Q96LR4 140 aa10.15□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C20orf144Q9BQM9 153 aa10.15□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa10.15□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TIMM9Q9Y5J7 89 aa10.15□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 OR10J4P0C629 311 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LEPP41159 167 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PDE6HQ13956 83 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ICAM4Q14773 271 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRR9Q5T870 116 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q6ZQT7 251 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BATF3Q9NR55 127 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ALG5Q9Y673 324 aa10.14□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PKHD1P08F94 4074 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 F5H768 121 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RTL8CO15255 209 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CD300CQ08708 224 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BTN1A1Q13410 526 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM122CQ6P4D5 195 aa10.13□□□□□ -0.79
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms