RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000437028.5

SNHG11-208, Transcript of small nucleolar RNA host gene 11, human

TSL 3

Gene SNHG11, Length 1,169 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG11-208	ENST00000437028	TRAV5	A0A0B4J249	113 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028		H3BMM0	161 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028		P0DMU3	169 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM231A	P0DMU4	169 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM231C	P0DMU5	169 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	HLA-DRB4	P13762	266 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	GALR1	P47211	349 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	SPATA31B1P	Q5VZV4	182 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	ACTR3C	Q9C0K3	210 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	XCL2	Q9UBD3	114 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		11.12	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM189	A5PLL7	270 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	UMAD1	C9J7I0	102 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	RPL7	P18124	248 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	ID1	P41134	155 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	CDC34	P49427	236 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	TAS2R45	P59539	299 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	C12orf74	Q32Q52	190 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	MORN5	Q5VZ52	161 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	BPIFA4P	Q86YQ2	179 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	GPR82	Q96P67	336 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	RPRM	Q9NS64	109 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	HERC2	O95714	4834 aa		11.11	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	11.1	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	SAMD13	Q5VXD3	122 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	C17orf77	Q96MU5	243 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	NEU1	Q99519	415 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	CELA1	Q9UNI1	258 aa		11.1	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	OR7C2	O60412	319 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	KHDC3L	Q587J8	217 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	RAB24	Q969Q5	203 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SNHG11-208	ENST00000437028	SOCS3	O14543	225 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	PSMB3	P49720	205 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF767P	Q75MW2	155 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	PHYHIPL	Q96FC7	376 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	LINC00052	Q96N35	136 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	CLUHP3	Q96NS8	147 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	PAXX	Q9BUH6	204 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	SLC25A2	Q9BXI2	301 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	OR51M1	Q9H341	326 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	SAV1	Q9H4B6	383 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	PLA2G2E	Q9NZK7	142 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	SNRPC	P09234	159 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	RAB5C	P51148	216 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	DEFB1	P60022	68 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	DPPA3	Q6W0C5	159 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	IQCF2	Q8IXL9	164 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM210B	Q96KR6	192 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF705F	A8MVS1	300 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	IGKV3-20	P01619	116 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF705B	P0CI00	300 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	PYY	P10082	97 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	FHIT	P49789	147 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	EBLN2	Q6P2I7	272 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	LCN15	Q6UWW0	184 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	FAM167A-AS1	Q96KT0	104 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	TMEM14C	Q9P0S9	112 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	MAP1LC3B2	A6NCE7	125 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028		H3BTX0	84 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	ISLR	O14498	428 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	OR10J4	P0C629	311 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	STAG3L2	P0CL84	134 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	STAG3L3	P0CL85	134 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	HIST1H1E	P10412	219 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	MEOX2	P50222	304 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	SULT1A2	P50226	295 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	EMP1	P54849	157 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	ZNF726P1	Q15940	193 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	PQLC2	Q6ZP29	291 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	SSX7	Q7RTT5	188 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	OR4B1	Q8NGF8	309 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	BLNK	Q8WV28	456 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	RNF141	Q8WVD5	230 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	C16orf92	Q96LL3	132 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	MAP1LC3B	Q9GZQ8	125 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028		A0A1B0GV50	99 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	11.04	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	CXorf1	O96002	111 aa		11.04	□□□□□ -0.64
SNHG11-208	ENST00000437028	H2AFB1	P0C5Y9	115 aa		11.04	□□□□□ -0.64

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