RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419303.5

PRAMENP-202, Transcript of PRAME N-terminal-like, pseudogene, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRAMENP, Length 1,869 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMENP-202ENST00000419303 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 INSIG2Q9Y5U4 225 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 LY6HO94772 140 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 CGB3P0DN86 165 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 CGB7P0DN87 165 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 TMEM190Q8WZ59 177 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 NPIPB3Q92617 1050 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 LEAP2Q969E1 77 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 GAFA1Q96PS6 74 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 SPATA25Q9BR10 227 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 TANC2Q9HCD6 1990 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 ICE1Q9Y2F5 2266 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 LYNX1G3V0Z9 82 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 LYNX1P0DP58 116 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 SLC25A16P16260 332 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 RAB9AP51151 201 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 CACNG7P62955 275 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 Q6AWC8 147 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 A0A096LNT2 108 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 NMUP48645 174 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 TMEM30BQ3MIR4 351 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 Q5PR19 223 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 FAM201AQ5SY85 155 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 Q86TA4 180 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 PIFOQ8TCI5 191 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 PIMREGQ9BSJ6 248 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 Q9H3A6 140 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 OTORQ9NRC9 128 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa8.4□□□□□ -1.06
PRAMENP-202ENST00000419303 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa8.4□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 HBDP02042 147 aa8.4□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 ORM2P19652 201 aa8.4□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 GCSHP23434 173 aa8.4□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 PIP4P2Q8N4L2 257 aa8.4□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 TMEM116Q8NCL8 245 aa8.4□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 IFI27L1Q96BM0 104 aa8.4□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 MRAP2Q96G30 205 aa8.4□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 CTSZQ9UBR2 303 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 U3KQK5 164 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 A0A096LNJ9 63 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 A0A1W2PRD5 423 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 A0A1W2PRF3 423 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 A0A1W2PRM7 423 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 hADV38S2A0JD32 116 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 LMO4P61968 165 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 ZNF493Q6ZR52 646 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 PRNTQ86SH4 94 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 PCP2Q8IVA1 136 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 PRELID3AQ96N28 172 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 BPESC1Q9GZL8 116 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 ABCA4P78363 2273 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 PKDREJQ9NTG1 2253 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 CACNA1DQ01668 2161 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 FASNP49327 2511 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 PTPN13Q12923 2485 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 C22orf46C9J442 243 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 FCN3O75636 299 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 IGKV1-16P04430 117 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 UTF1Q5T230 341 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 ZNRF1Q8ND25 227 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 OR10X1Q8NGY0 326 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 C8orf46Q8TAG6 207 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 TRGV9Q99603 122 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 CCL13Q99616 98 aa8.38□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 E9PLD3 99 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 GP9P14770 177 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 WFDC2Q14508 124 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 LYPD2Q6UXB3 125 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 ORMDL3Q8N138 153 aa8.37□□□□□ -1.07
PRAMENP-202ENST00000419303 DEFB108BQ8NET1 73 aa8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62 ms