RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 PET117Q6UWS5 81 aa14.67□□□□□ -0.06
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SH3BP1-202ENST00000417536 UBTD1Q9HAC8 227 aa14.67□□□□□ -0.06
SH3BP1-202ENST00000417536 AP5S1Q9NUS5 200 aa14.67□□□□□ -0.06
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SH3BP1-202ENST00000417536 MS4A6AQ9H2W1 248 aa14.59□□□□□ -0.07
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SH3BP1-202ENST00000417536 LOC105371242A0A075B767 164 aa14.58□□□□□ -0.08
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SH3BP1-202ENST00000417536 A0A096LNJ9 63 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 S100A7AQ86SG5 101 aa14.57□□□□□ -0.08
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SH3BP1-202ENST00000417536 C11orf71Q6IPW1 123 aa14.57□□□□□ -0.08
SH3BP1-202ENST00000417536 C12orf54Q6X4T0 127 aa14.57□□□□□ -0.08
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SH3BP1-202ENST00000417536 FAM104BQ5XKR9 115 aa14.56□□□□□ -0.08
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