RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 MIR22HGQ0VDD5 57 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-552P-201ENST00000362869 SNCBQ16143 134 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-552P-201ENST00000362869 OCIAD2Q56VL3 154 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOXI2Q6ZQN5 318 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM216BQ8N7L0 139 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-552P-201ENST00000362869 GINS3Q9BRX5 216 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-552P-201ENST00000362869 RTL8AQ9BWD3 113 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTPRFP10586 1907 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-552P-201ENST00000362869 NISCHQ9Y2I1 1504 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPTBP11277 2137 aa0.16□□□□□ -2.38
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A0J9YY99 117 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCL4P13236 92 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP1R2P41236 205 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPINT3P49223 89 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 C6orf52Q5T4I8 152 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q6ZQY7 126 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR13C6PQ8NH95 151 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR2H1Q9GZK4 316 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 CST11Q9H112 138 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 SS18L2Q9UHA2 77 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP0.15□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 COL24A1Q17RW2 1714 aa0.15□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 FANCMQ8IYD8 2048 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAT4Q6V0I7 4981 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD109Q6YHK3 1445 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 CST7O76096 145 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 KDELR1P24390 212 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPL35P42766 123 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPL19P84098 196 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 RTL8BQ17RB0 113 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 FKBP1CQ5VVH2 108 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMED4Q7Z7H5 227 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC00269Q8N2A0 174 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLAC4Q8WY50 150 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCL19Q99731 98 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 LIMD2Q9BT23 127 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP0.14□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa0.14□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYLKQ15746 1914 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 A6NN06 94 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 MFSD11O43934 449 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 CSN2P05814 226 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDE6GP18545 87 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 GNG3P63215 75 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 POU6F1Q14863 301 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q86TA4 180 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 C10orf111Q8N326 155 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLEKHB2Q96CS7 222 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 STOML2Q9UJZ1 356 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 RTL9Q8NET4 1388 aa0.13□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 H3BQV1 296 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 PIAS1O75925 651 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV3-30P01768 117 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP0.12□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 LTC4SQ16873 150 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 VMA21Q3ZAQ7 101 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMIM20Q8N5G0 67 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 NEK7Q8TDX7 302 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSKUQ8WUA8 353 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 AP3S1Q92572 193 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 MCEEQ96PE7 176 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR4C12Q96R67 309 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 EFCAB11Q9BUY7 163 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 TPRKBQ9Y3C4 175 aa0.12□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBR2Q8IWV8 1755 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 MT-ND6P03923 174 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 LYG2Q86SG7 212 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 CROCCP2Q86T23 111 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRR15Q8IV56 129 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCL4L1Q8NHW4 92 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRPEL2Q8TAA5 225 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 CARD19Q96LW7 228 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 OTORQ9NRC9 128 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 IL20Q9NYY1 176 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 UFC1Q9Y3C8 167 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNCP24821 2201 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAST4O15021 2626 aa0.11□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 SULT1C4O75897 302 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 FABP4P15090 132 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAV3P56539 151 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCTAP57738 103 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAS2R41P59536 307 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 BASP1P80723 227 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 QRFPP83859 136 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 C10orf99Q6UWK7 81 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 C5orf17Q8NAS9 161 aa0.1□□□□□ -2.39
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR4B1Q8NGF8 309 aa0.1□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.9 ms