RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353284.7

PTPRS-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRS, Length 4,518 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-202ENST00000353284 TOMM40O96008 361 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 RPRMLQ8N4K4 120 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 SMKR1H3BMG3 65 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 IGKCP01834 107 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 TRGV3P03979 118 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 Q6ZSR3 168 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 MED12LQ86YW9 2145 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 ASIPP42127 132 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 ANKRD29Q8N6D5 301 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 C15orf65H3BRN8 121 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 JMJD8Q96S16 334 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 PPDPFLQ8WWR9 84 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 DYSFO75923 2080 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 IGFL4Q6B9Z1 124 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 Q86TA4 180 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 TMEM178BH3BS89 294 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 DKK1O94907 266 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 SIGLEC9Q9Y336 463 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 PLA2G5P39877 138 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 TMEM258P61165 79 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 FAM168AQ92567 244 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 PRR20EP86478 221 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 PRR20CP86479 221 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 PRR20DP86480 221 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 PRR20BP86481 221 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 PRR20AP86496 221 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 LYPD2Q6UXB3 125 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 TMEM126AQ9H061 195 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 EML6Q6ZMW3 1958 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 K7EP34 96 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 MMP23AO75900 390 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 PDLIM4P50479 330 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 C2orf82Q6UX34 121 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 CEP350Q5VT06 3117 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 GLMPQ8WWB7 406 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 CFHR2P36980 270 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 RHOGP84095 191 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 SLC25A2Q9BXI2 301 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 C9orf118A6NHY6 69 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 C9JAW5 83 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 NPIPB6E9PJ23 425 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 C17orf58Q2M2W7 97 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 SPANXCQ9NY87 97 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 WNK1Q9H4A3 2382 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 SH2D1AO60880 128 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 IGHV3-11P01762 117 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 IGHG3P01860 377 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 WT1-ASQ06250 92 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP9.72□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 PCNTO95613 3336 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 F8W1H4 67 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 VWC2Q2TAL6 325 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 U3KQE9 123 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 FAM231DQ6ZW35 169 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 SLC50A1Q9BRV3 221 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 C11orf1Q9H5F2 150 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 TMEM213A2RRL7 107 aa9.71□□□□□ -0.85
PTPRS-202ENST00000353284 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 F5H768 121 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 ATXN8Q156A1 80 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 ZNF815PA8K554 130 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 H3BRM9 83 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 CEACAM4O75871 244 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 COX6B1P14854 86 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 A4D1N5 150 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 PPP1R17O96001 155 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 RNF183Q96D59 192 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 ERG28Q9UKR5 140 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 Q6ZPA2 131 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 LINC00527Q9UJ94 153 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 TMEM158Q8WZ71 300 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 GFRA4Q9GZZ7 299 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa9.69□□□□□ -0.86
PTPRS-202ENST00000353284 KLRD1Q13241 179 aa9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms