RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 NDUFB4O95168 129 aa14□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM208Q9BTX3 173 aa14□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL32Q9BYC8 188 aaKnown RBP14□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 WFDC1Q9HC57 220 aa14□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRAV10A0A0B4J240 114 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 LY6G6CO95867 125 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 RRN3P1Q2M238 152 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa13.99□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 IFNA5P01569 189 aa13.98□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 PDE6HQ13956 83 aa13.98□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10J6PQ8NGY7 276 aa13.98□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 DKK2Q9UBU2 259 aa13.98□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 FUT9Q9Y231 359 aa13.98□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 M0R3E3 92 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPART-AS1P0CW21 52 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 CDKN1BP46527 198 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 RGS21Q2M5E4 152 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 FFAR4Q5NUL3 377 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM222AQ5U5X8 452 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCGB1C1Q8TD33 95 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 BLNKQ8WV28 456 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 YTHDF2Q9Y5A9 579 aaKnown RBP13.97□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 TIMM9Q9Y5J7 89 aa13.97□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 KMT2AQ03164 3969 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGLL5B9A064 214 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPIPB6E9PJ23 425 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRM2P04554 102 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 GIPP09681 153 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIR3DS1Q14943 382 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 FXYD5Q96DB9 178 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR51M1Q9H341 326 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 APLNQ9ULZ1 77 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 DNAH6Q9C0G6 4158 aa13.96□□□□□ -0.17
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 TCTAP57738 103 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q5BKY6 102 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAXXQ9BUH6 204 aa13.95□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP13.95□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10J4P0C629 311 aa13.94□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 CT45A10P0DMU9 189 aa13.94□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 OXA1LQ15070 435 aa13.94□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 LGALS9CQ6DKI2 356 aa13.94□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM256Q8N2U0 113 aa13.94□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ASB13Q8WXK3 278 aa13.94□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF503Q96F45 646 aa13.94□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 AQP10Q96PS8 301 aa13.94□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ODF3Q96PU9 254 aa13.94□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRELID1Q9Y255 219 aa13.94□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa13.93□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLAC8L1A1L4L8 177 aa13.93□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 NBEAP1P0C6P0 100 aa13.93□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSPOP30536 169 aa13.93□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 GFI1BQ5VTD9 330 aa13.93□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 PHYHIPLQ96FC7 376 aa13.93□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 LINC01587Q99440 93 aa13.93□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa13.93□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 AAMDCQ9H7C9 122 aa13.93□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa13.93□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR7C2O60412 319 aa13.92□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 AZU1P20160 251 aa13.92□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAS2R60P59551 318 aa13.92□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ICAM4Q14773 271 aa13.92□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF141Q8WVD5 230 aa13.92□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP13.91□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 LEPP41159 167 aa13.91□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERCC8Q13216 396 aa13.91□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 KHDC3LQ587J8 217 aa13.91□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 C20orf144Q9BQM9 153 aa13.91□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 RAB2AP61019 212 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM122CQ6P4D5 195 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 H7BYZ3 331 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 J3KRW8 73 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 M6PRP20645 277 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 TAS2R45P59539 299 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF266Q14584 549 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM19A4Q96LR4 140 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF222A6NCQ9 220 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 LYRM9A8MSI8 78 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 G3V3Q6 166 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 DAD1P61803 113 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2T35Q8NGX2 323 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 C16orf74Q96GX8 76 aa13.88□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa13.87□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 HTN1P15515 57 aa13.87□□□□□ -0.19
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2G3Q8NGZ4 309 aa13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43 ms