RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 NQO2P16083 231 aa8.63□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 HOXA5P20719 270 aa8.63□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 S100PP25815 95 aa8.63□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 PSMB3P49720 205 aa8.63□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 CCL20P78556 96 aa8.63□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 DLK1P80370 383 aa8.63□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 SLC38A11Q08AI6 406 aa8.63□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 C12orf74Q32Q52 190 aa8.63□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa8.63□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 Q8N1X5 172 aa8.63□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 OR10P1Q8NGE3 313 aa8.63□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 MS4A6AQ9H2W1 248 aa8.63□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 TMEM14BQ9NUH8 114 aa8.63□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP8.63□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 F11RQ9Y624 299 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 X6R8D5 127 aa8.63□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa8.62□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa8.62□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 F8W735 103 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 K7EIM0 57 aa8.62□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 TNFSF12O43508 249 aa8.62□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 RPL11P62913 178 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 WT1-ASQ06250 92 aa8.62□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 ELOBQ15370 118 aa8.62□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 POU2AF1Q16633 256 aa8.62□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 FAM24BQ8N5W8 94 aa8.62□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa8.62□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.62□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 SDF2L1Q9HCN8 221 aa8.62□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 NAT8Q9UHE5 227 aa8.62□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 TEX50A0A1B0GTY4 177 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 RPL35P42766 123 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 SPCS3P61009 180 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 ZNF709Q8N972 641 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 ANAPC16Q96DE5 110 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 FAM210BQ96KR6 192 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 IMMP2LQ96T52 175 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 GPHA2Q96T91 129 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 TXN2Q99757 166 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 PYGO2Q9BRQ0 406 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 HINT2Q9BX68 163 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 RBKSQ9H477 322 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 TMEM140Q9NV12 185 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 CELA1Q9UNI1 258 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 PMS2P5A8MQ11 134 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 METTL15P1P0C7V9 234 aa8.61□□□□□ -1.03
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SPC25-201ENST00000282074 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 DTD1Q8TEA8 209 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 ZNF414Q96IQ9 312 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 OR51M1Q9H341 326 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 SCRT2Q9NQ03 307 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 RABAC1Q9UI14 185 aa8.61□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 PDE6DO43924 150 aa8.6□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 ERVK-16P61578 105 aa8.6□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.6□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 VSIRQ9H7M9 311 aa8.6□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa8.6□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 CLEC5AQ9NY25 188 aa8.6□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 GNG13Q9P2W3 67 aa8.6□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 AGRNO00468 2067 aa8.59□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 F6UZH7 168 aa8.59□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 PPP1R2P9O14990 202 aa8.59□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 RAB11AP62491 216 aa8.59□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 ARL16Q0P5N6 197 aa8.59□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 ZNF726P1Q15940 193 aa8.59□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 TMEM241Q24JQ0 296 aa8.59□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.59□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 OR1P1Q8NH06 330 aa8.59□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 ISOC2Q96AB3 205 aa8.59□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 RSG1Q9BU20 258 aa8.59□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 DOK5Q9P104 306 aa8.59□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 WDR83OSQ9Y284 106 aa8.59□□□□□ -1.03
SPC25-201ENST00000282074 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SPC25-201ENST00000282074 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.58□□□□□ -1.04
SPC25-201ENST00000282074 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.58□□□□□ -1.04
SPC25-201ENST00000282074 A0A1W2PS18 150 aa8.58□□□□□ -1.04
SPC25-201ENST00000282074 MARCH11A6NNE9 402 aa8.58□□□□□ -1.04
SPC25-201ENST00000282074 ZNF727A8MUV8 499 aa8.58□□□□□ -1.04
SPC25-201ENST00000282074 GNG7O60262 68 aa8.58□□□□□ -1.04
SPC25-201ENST00000282074 TYMSP04818 313 aa8.58□□□□□ -1.04
SPC25-201ENST00000282074 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.58□□□□□ -1.04
SPC25-201ENST00000282074 OPRK1P41145 380 aa8.58□□□□□ -1.04
SPC25-201ENST00000282074 RPS10P46783 165 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
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