RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 KLF12Q9Y4X4 402 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 TSPOP30536 169 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 LYZL1Q6UWQ5 148 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 OR4B1Q8NGF8 309 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 C19orf84I3L1E1 186 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 LEPROTL1O95214 131 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 EVI2AP22794 236 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 FMC1Q96HJ9 113 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 C18orf15Q96N68 181 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.78□□□□□ -1.32
GINS1-201ENST00000262460 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.77□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 A0A087X0K7 114 aa6.77□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 D6R8Y8 96 aa6.77□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.77□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 OVOL3O00110 214 aa6.77□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 LINC00614P0C842 121 aa6.77□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 TMEM30BQ3MIR4 351 aa6.77□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 MPV17L2Q567V2 206 aa6.77□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 WFDC12Q8WWY7 111 aa6.77□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 ARPC1AQ92747 370 aa6.77□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 OTORQ9NRC9 128 aa6.77□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.77□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.77□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 K7EMI3 77 aa6.77□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 CHODLQ9H9P2 273 aa6.77□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 CBY3A6NI87 242 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 DLEU1O43261 78 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 CLEC3BP05452 202 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 TNFRSF14Q92956 283 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 H3BRN7 92 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 RELQ04864 619 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 RAB1BQ9H0U4 201 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 C21orf62Q9NYP8 219 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 SH2D1AO60880 128 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 ORM1P02763 201 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 IGF1P05019 195 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 C15orf32Q32M92 178 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 TM4SF20Q53R12 229 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 NRGNQ92686 78 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 RNF24Q9Y225 148 aa6.76□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 A0A1B0GUT8 65 aa6.75□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.75□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 CTSGP08311 255 aa6.75□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 LY6EQ16553 131 aa6.75□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 PSG3Q16557 428 aa6.75□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.75□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.75□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa6.75□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 ATP6V0E1O15342 81 aa6.75□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 NUDT3O95989 172 aa6.75□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.75□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 TIMD4Q96H15 378 aa6.75□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.74□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 SRD5A1P18405 259 aa6.74□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 TWIST1Q15672 202 aa6.74□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.74□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa6.74□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 CCL25O15444 150 aa6.74□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 IGHV3-11P01762 117 aa6.74□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 IGHG4P01861 327 aa6.74□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 SAA4P35542 130 aa6.74□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 MSRB2Q9Y3D2 182 aa6.74□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.74□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 TRBV12-3P01733 135 aa6.74□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 MFAP4P55083 255 aa6.74□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 RHOGP84095 191 aa6.74□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
GINS1-201ENST00000262460 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.74□□□□□ -1.33
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