RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000256413.7

CTIF-201, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 5,750 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-201ENST00000256413 PTPRDP23468 1912 aa12.95□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 ERCC8Q13216 396 aa12.95□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 A0A087WX48 190 aa12.95□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa12.95□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
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CTIF-201ENST00000256413 LINC01545Q5VT33 79 aa12.95□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa12.95□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa12.94□□□□□ -0.34
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CTIF-201ENST00000256413 RNF5Q99942 180 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 SYNJ2BPP57105 145 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 ANKRD39Q53RE8 183 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 FAM168AQ92567 244 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 IGKV1-16P04430 117 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 IGHV1-46P01743 117 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 TEN1Q86WV5 123 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa12.94□□□□□ -0.34
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CTIF-201ENST00000256413 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa12.94□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 A0A087WWL8 130 aa12.93□□□□□ -0.34
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CTIF-201ENST00000256413 CFC1P0CG37 223 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 TMEM258P61165 79 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 TRBV19A0A075B6N1 114 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 CHCHD5Q9BSY4 110 aa12.93□□□□□ -0.34
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CTIF-201ENST00000256413 FOXI1Q12951 378 aa12.93□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 LINC00173Q6ZV60 143 aa12.93□□□□□ -0.34
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CTIF-201ENST00000256413 ACYP1P07311 99 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 IGHV1-8P0DP01 117 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 FANCMQ8IYD8 2048 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 EFNA4P52798 201 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 SDK2Q58EX2 2172 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 CEP290O15078 2479 aa12.92□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 J3QQQ9 107 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 A0A1W2PPI3 338 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 PINLYPA6NC86 204 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 COL4A5P29400 1685 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 FDCSPQ8NFU4 85 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 C1orf159Q96HA4 380 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 TMEM105Q8N8V8 129 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 SMIM2Q9BVW6 85 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 SHANK3Q9BYB0 1731 aa12.91□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 LCTP09848 1927 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa12.9□□□□□ -0.34
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CTIF-201ENST00000256413 SBF2Q86WG5 1849 aa12.9□□□□□ -0.34
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CTIF-201ENST00000256413 FXYD2P54710 66 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa12.9□□□□□ -0.34
CTIF-201ENST00000256413 DTX2Q86UW9 622 aa12.9□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 LINC01560Q8TB33 94 aa12.9□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 FXYD5Q96DB9 178 aa12.9□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa12.9□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 NDUFA12Q9UI09 145 aa12.9□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 PRR20EP86478 221 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 PRR20CP86479 221 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 PRR20DP86480 221 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 PRR20BP86481 221 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 PRR20AP86496 221 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 HERV-K104P63124 156 aa12.89□□□□□ -0.35
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CTIF-201ENST00000256413 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 PRR25Q96S07 402 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 ZNF415Q09FC8 603 aa12.89□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa12.89□□□□□ -0.35
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CTIF-201ENST00000256413 IGLV3-19P01714 112 aa12.88□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 HAMPP81172 84 aa12.88□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 C3orf36Q3SXR2 165 aa12.88□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 C6orf226Q5I0X4 101 aa12.88□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 NDPQ00604 133 aa12.88□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 TMEM14CQ9P0S9 112 aa12.88□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 FAM120AOSQ5T036 256 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 GAFA1Q96PS6 74 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 HIGD1BQ9P298 99 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 SHISA9B4DS77 424 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 RS1O15537 224 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 RNF183Q96D59 192 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 CEP250Q9BV73 2442 aa12.87□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 C5orf64Q2M2E5 130 aa12.86□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 STHQ8IWL8 128 aa12.86□□□□□ -0.35
CTIF-201ENST00000256413 PEMTQ9UBM1 199 aa12.86□□□□□ -0.35
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