RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255198.2

ZBED3-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED3, Length 6,172 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-201ENST00000255198 IGHV1-69P01742 117 aa16.47■□□□□ 0.23
ZBED3-201ENST00000255198 C9orf153Q5TBE3 101 aa16.47■□□□□ 0.23
ZBED3-201ENST00000255198 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa16.47■□□□□ 0.23
ZBED3-201ENST00000255198 hADV29S1A0JD25 119 aa16.47■□□□□ 0.23
ZBED3-201ENST00000255198 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
ZBED3-201ENST00000255198 E9PQ18 207 aa16.47■□□□□ 0.23
ZBED3-201ENST00000255198 IGKV1-39P01597 117 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED3-201ENST00000255198 IGKV1D-39P04432 117 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED3-201ENST00000255198 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED3-201ENST00000255198 TMEM190Q8WZ59 177 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED3-201ENST00000255198 TMEM75Q8N9X5 138 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED3-201ENST00000255198 DEFB105AQ8NG35 78 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED3-201ENST00000255198 UBE2E1P51965 193 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED3-201ENST00000255198 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED3-201ENST00000255198 A0A1B0GW64 132 aa16.46■□□□□ 0.23
ZBED3-201ENST00000255198 CR1LQ2VPA4 569 aa16.46■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 C2orf66Q6UXQ4 117 aa16.46■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 PFN1P07737 140 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 ANGP03950 147 aaKnown RBP16.45■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 LY96Q9Y6Y9 160 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 HLA-DRB4P13762 266 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 GAS1P54826 345 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 B3GALT5-AS1P59052 145 aa16.45■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 UBE2BP63146 152 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 TMEM141Q96I45 108 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 A0A0J9YY99 117 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 RHODO00212 210 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 DLEU1O43261 78 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 TEX36Q5VZQ5 186 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 Q6ZRM9 215 aa16.44■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF124Q15973 351 aa16.43■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 C8orf86Q6ZUL3 223 aa16.43■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 Q6ZS92 163 aa16.43■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 DSCR8Q96T75 97 aa16.43■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 GFRA4Q9GZZ7 299 aa16.43■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 A0A1B0GUS0 222 aa16.42■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa16.42■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 IGLV2-23P01705 113 aa16.42■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa16.42■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 RMI2Q96E14 147 aa16.42■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 ZMAT4Q9H898 229 aa16.42■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 ASPHD1Q5U4P2 390 aa16.42■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 RTTNQ86VV8 2226 aa16.41■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 UBL5Q9BZL1 73 aa16.41■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa16.41■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 SDHAF1A6NFY7 115 aa16.41■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 PDE6HQ13956 83 aa16.41■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 GATA3P23771 443 aa16.41■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 Q9HAA7 133 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 UBE2V1Q13404 147 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 PRSS46E5RG02 174 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 Q8N8P6 123 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 SMIM2Q9BVW6 85 aa16.4■□□□□ 0.22
ZBED3-201ENST00000255198 FAM120AOSQ5T036 256 aa16.39■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 THADAQ6YHU6 1953 aa16.39■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 TAF1LQ8IZX4 1826 aa16.39■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa16.39■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 FAM231BA6NCW3 169 aa16.39■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 CDKN1BP46527 198 aa16.39■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 Q6ZQT7 251 aa16.39■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 CLPSL1A2RUU4 121 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 DKK4Q9UBT3 224 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 CYYR1Q96J86 154 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 RS1O15537 224 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 CRYGCP07315 174 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 INAFM2P0DMQ5 153 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 QRFPP83859 136 aa16.38■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 FGF6P10767 208 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF664Q8N3J9 261 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 ARID2Q68CP9 1835 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 NDUFA12Q9UI09 145 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 IGHG4P01861 327 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 FAM104BQ5XKR9 115 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 XCL1P47992 114 aa16.37■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 MPDZO75970 2070 aa16.36■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 PYY3Q5JQD4 70 aa16.36■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 TRBV19A0A075B6N1 114 aa16.36■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 TPSG1Q9NRR2 321 aa16.35■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 K7ENP7 123 aa16.35■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 J3QKU1 62 aa16.34■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa16.34■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 NRXN2Q9P2S2 1712 aa16.34■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 ZNF492Q9P255 531 aa16.34■□□□□ 0.21
ZBED3-201ENST00000255198 DOCK3Q8IZD9 2030 aa16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 172.4 ms