RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000237247.10

SGIP1-201, Transcript of SH3 domain GRB2 like endophilin interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SGIP1, Length 3,997 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1-201ENST00000237247 PATE2Q6UY27 113 aa5.01□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 FAM168AQ92567 244 aa5.01□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 APOHP02749 345 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF688P0C7X2 276 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 TAL2Q16559 108 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 C9orf106Q8NAJ2 232 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 OR10J6PQ8NGY7 276 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 PIMREGQ9BSJ6 248 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 HIGD1CA8MV81 97 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 OVOL3O00110 214 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 RPL7P18124 248 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 LGALS9BQ3B8N2 356 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 LGALS9CQ6DKI2 356 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 TEN1Q86WV5 123 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 TMEM101Q96IK0 257 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 CARD19Q96LW7 228 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 SPANXDQ9BXN6 97 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 TMEM160Q9NX00 188 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 DYSFO75923 2080 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 CGB1A6NKQ9 187 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 FXYD2P54710 66 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 MSMPQ1L6U9 139 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 SSX8Q7RTT4 187 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 PRSS33Q8NF86 280 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 LINC00479Q96M42 142 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 UBTD1Q9HAC8 227 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 PROCRQ9UNN8 238 aa5□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 TRAV5A0A0B4J249 113 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 CRLF1O75462 422 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 CRYGDP07320 174 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 GP9P14770 177 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 COL8A1P27658 744 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 NBL1P41271 181 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 TTC32Q5I0X7 151 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 BAALCQ8WXS3 180 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 USF3Q68DE3 2245 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 DNAH3Q8TD57 4116 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 NDUFS7O75251 213 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 IGLV2-23P01705 113 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 ORM1P02763 201 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 MORN5Q5VZ52 161 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 ZNRF1Q8ND25 227 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 NUP37Q8NFH4 326 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF747Q9BV97 191 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 OTORQ9NRC9 128 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 KNL1Q8NG31 2342 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 C9JAW5 83 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 LINC00694P0DN24 101 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 ORM2P19652 201 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 RRN3P1Q2M238 152 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 TMEM219Q86XT9 240 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 PIP4P2Q8N4L2 257 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 TMEM116Q8NCL8 245 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 OR4C13Q8NGP0 309 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 ITLN1Q8WWA0 313 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 AJUBAQ96IF1 538 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 RITA1Q96K30 269 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 HIGD1AQ9Y241 93 aa4.99□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 SHISA9B4DS77 424 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 UTF1Q5T230 341 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 MOB3BQ86TA1 216 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 SPINK4O60575 86 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 IGKV1-16P04430 117 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 GCSHP23434 173 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 COX8CQ7Z4L0 72 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 Q86TA4 180 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 CEND1Q8N111 149 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 TMEM75Q8N9X5 138 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 LINC01600Q96MT4 127 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 RASL11BQ9BPW5 248 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 TRAV17A0A0B4J275 112 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 LINC01619G3V211 115 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 P01737 135 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 TCRAP04437 139 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 WT1-ASQ06250 92 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 ZNF493Q6ZR52 646 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 LYPD1Q8N2G4 141 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 U3KQK5 164 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 CSMD2Q7Z408 3487 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 CSMD1Q96PZ7 3565 aa4.98□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP4.97□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 M0R2P5 195 aa4.97□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 PYYP10082 97 aa4.97□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 CFHR4Q92496 578 aa4.97□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
SGIP1-201ENST00000237247 KIR2DL4Q99706 377 aa4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms