RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 IL17DQ8TAD2 202 aa16.12■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 HMSDA8MTL9 139 aa16.11■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 DEFB4AO15263 64 aa16.11■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa16.11■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 OR10G4Q8NGN3 311 aa16.11■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 OR10G9Q8NGN4 311 aa16.11■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 OR10G7Q8NGN6 311 aa16.11■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 M0R2Z0 102 aa16.1■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 SERF2P84101 59 aa16.1■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 ZFAND6Q6FIF0 208 aa16.1■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 KCNRGQ8N5I3 272 aa16.1■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa16.09■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 TAAR5O14804 337 aa16.09■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 OR7C2O60412 319 aa16.09■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 MIFP14174 115 aa16.09■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 SPINK13Q1W4C9 94 aa16.09■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 FAM122CQ6P4D5 195 aa16.09■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 PHYHIPLQ96FC7 376 aa16.09■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.17
SYF2-201ENST00000236273 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa16.08■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 ZNF345Q14585 488 aa16.08■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 KHDC3LQ587J8 217 aa16.08■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 NEU1Q99519 415 aa16.08■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 TENM2Q9NT68 2774 aa16.08■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PPV4 95 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 TAS2R45P59539 299 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 ICAM4Q14773 271 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 PRELID1Q9Y255 219 aa16.07■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 NPIPB6E9PJ23 425 aa16.06■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa16.06■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 JTBO76095 146 aa16.06■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 KIR3DS1Q14943 382 aa16.06■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa16.05■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 AMBPP02760 352 aa16.05■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 STAG3L2P0CL84 134 aa16.05■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 STAG3L3P0CL85 134 aa16.05■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 CT45A10P0DMU9 189 aa16.05■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 SSX7Q7RTT5 188 aa16.05■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 BAP18Q8IXM2 172 aa16.05■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 OR10J6PQ8NGY7 276 aa16.05■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 RAB24Q969Q5 203 aa16.05■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 MBP02144 154 aa16.04■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 RANP62826 216 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 PQLC2Q6ZP29 291 aa16.04■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 TCTE3Q8IZS6 198 aa16.04■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 ERCC8Q13216 396 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 ZNF726P1Q15940 193 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 LYPD1Q8N2G4 141 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 SUN5Q8TC36 379 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 ARPC5LQ9BPX5 153 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 Q9H3A6 140 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 AAMDCQ9H7C9 122 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 SACSQ9NZJ4 4579 aa16.03■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 A0A0D9SG52 128 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 PRM2P04554 102 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 CDKN1BP46527 198 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 FAM19A4Q96LR4 140 aa16.02■□□□□ 0.16
SYF2-201ENST00000236273 SMIM9A6NGZ8 99 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 ARL14EPLP0DKL9 152 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 ODF3Q96PU9 254 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 C11orf45Q8TAV5 145 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 VGLL1Q99990 258 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 BCL2L11O43521 198 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 INSP01308 110 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 LINC00477Q96M19 166 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 CELA1Q9UNI1 258 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GVG6 124 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 GCHFRP30047 84 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 PMS2P11Q13670 270 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 TMUB2Q71RG4 321 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 OTORQ9NRC9 128 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 LYSTQ99698 3801 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 PGPA6NDG6 321 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 CD300CQ08708 224 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 GFI1BQ5VTD9 330 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 RYR3Q15413 4870 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 DIRC3C9JPN6 131 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 AZU1P20160 251 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-201ENST00000236273 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms