RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613246.4

PTPRJ-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 7,851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-207ENST00000613246 F5H768 121 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRJ-207ENST00000613246 RNF222A6NCQ9 220 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRJ-207ENST00000613246 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRJ-207ENST00000613246 IGKV1-13P0DP09 117 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRJ-207ENST00000613246 C5orf67F2Z3F1 127 aa15.32■□□□□ 0.04
PTPRJ-207ENST00000613246 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa15.31■□□□□ 0.04
PTPRJ-207ENST00000613246 SP9P0CG40 484 aa15.31■□□□□ 0.04
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PTPRJ-207ENST00000613246 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRJ-207ENST00000613246 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM223BA6NKX1 122 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRJ-207ENST00000613246 FAM223AQ8IWN6 122 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRJ-207ENST00000613246 IFI6P09912 130 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRJ-207ENST00000613246 SEC61GP60059 68 aa15.21■□□□□ 0.03
PTPRJ-207ENST00000613246 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
PTPRJ-207ENST00000613246 WBP1Q96G27 269 aa15.21■□□□□ 0.03
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