RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599454.5

PNKP-212, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

TSL 3

Gene PNKP, Length 529 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-212ENST00000599454 LINC00869P0C866 280 aa14.76□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 TTC32Q5I0X7 151 aa14.76□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 C20orf144Q9BQM9 153 aa14.76□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 ADAP1O75689 374 aa14.75□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 HTN1P15515 57 aa14.75□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 CXCL2P19875 107 aa14.75□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 ID3Q02535 119 aa14.75□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 MCFD2Q8NI22 146 aa14.75□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 ZNF503Q96F45 646 aa14.75□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 Q9H8V8 135 aa14.75□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 H7BYZ3 331 aa14.74□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 NOL3O60936 208 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 UHRF2Q96PU4 802 aa14.74□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 PSENENQ9NZ42 101 aa14.74□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 FNDC10F2Z333 226 aa14.73□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 K7EPK0 472 aa14.73□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 DLK1P80370 383 aa14.73□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 PYDC2Q56P42 97 aa14.73□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 PXDC1Q5TGL8 231 aa14.73□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 SPATA12Q7Z6I5 190 aa14.73□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 Q8N1X5 172 aa14.73□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 PMS2P5A8MQ11 134 aa14.72□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 BTF3P20290 206 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP14.72□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 LCN15Q6UWW0 184 aa14.72□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 LINC00612Q8N6U2 182 aa14.72□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 RXFP4Q8TDU9 374 aa14.72□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 SMIM8Q96KF7 97 aa14.72□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 SLC50A1Q9BRV3 221 aa14.72□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 ARL6Q9H0F7 186 aa14.72□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 NPVFQ9HCQ7 196 aa14.72□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 A0A1W2PPQ1 181 aa14.71□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 M6PRP20645 277 aa14.71□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 CCDC28AQ8IWP9 274 aa14.71□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 UPK3BQ9BT76 320 aa14.71□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 ARV1Q9H2C2 271 aa14.71□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 Q9H3A6 140 aa14.71□□□□□ -0.05
PNKP-212ENST00000599454 H3BMQ9 156 aa14.7□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 H3BNG1 76 aa14.7□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 OR5I1Q13606 314 aa14.7□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 TEPPQ6URK8 271 aa14.7□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa14.69□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 SSSCA1O60232 199 aa14.69□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa14.69□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 PATE2Q6UY27 113 aa14.69□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 MGAT4CQ9UBM8 478 aa14.69□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 V9GYH0 126 aa14.69□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 C9orf170A2RU37 121 aa14.68□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 RLN2P04090 185 aa14.68□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 C4orf46Q504U0 113 aa14.68□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 ZNF546Q86UE3 836 aa14.68□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 CCDC190Q86UF4 302 aa14.68□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 OR10P1Q8NGE3 313 aa14.68□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 METTL15P1P0C7V9 234 aa14.67□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa14.67□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa14.67□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 SCRT2Q9NQ03 307 aa14.67□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 SNURFLB1AK76 121 aa14.66□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 GOSR2O14653 212 aa14.66□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 CCNKO75909 580 aa14.66□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 SLC38A11Q08AI6 406 aa14.66□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.66□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 LINC00305Q7Z4B0 112 aa14.66□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 APOBP04114 4563 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 A0A0J9YY99 117 aa14.65□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 TSC22D2O75157 780 aa14.65□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 HOXA5P20719 270 aa14.65□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 S100A5P33763 92 aa14.65□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 TAS2R30P59541 319 aa14.65□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 ESRGQ1W209 222 aa14.65□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 ODF3Q96PU9 254 aa14.65□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 GGACTQ9BVM4 153 aa14.65□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.65□□□□□ -0.06
PNKP-212ENST00000599454 GAGE12BA1L429 117 aa14.64□□□□□ -0.07
PNKP-212ENST00000599454 GAGE7O76087 117 aa14.64□□□□□ -0.07
PNKP-212ENST00000599454 GAGE12FP0CL80 117 aa14.64□□□□□ -0.07
PNKP-212ENST00000599454 GAGE12GP0CL81 117 aa14.64□□□□□ -0.07
PNKP-212ENST00000599454 GAGE12IP0CL82 117 aa14.64□□□□□ -0.07
PNKP-212ENST00000599454 KIR3DS1Q14943 382 aa14.64□□□□□ -0.07
PNKP-212ENST00000599454 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
PNKP-212ENST00000599454 LEPP41159 167 aa14.63□□□□□ -0.07
PNKP-212ENST00000599454 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PNKP-212ENST00000599454 PYGO2Q9BRQ0 406 aa14.63□□□□□ -0.07
PNKP-212ENST00000599454 DNAH5Q8TE73 4624 aa14.62□□□□□ -0.07
PNKP-212ENST00000599454 NAP1L6A6NFF2 107 aa14.62□□□□□ -0.07
PNKP-212ENST00000599454 AGPAT2O15120 278 aa14.62□□□□□ -0.07
PNKP-212ENST00000599454 COX7A2P2O60397 106 aa14.62□□□□□ -0.07
PNKP-212ENST00000599454 NDUFB6O95139 128 aa14.62□□□□□ -0.07
PNKP-212ENST00000599454 KRTAP10-2P60368 255 aa14.62□□□□□ -0.07
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