RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
EFTUD2-226ENST00000593200 SMCO3A2RU48 225 aa7.15□□□□□ -1.26
EFTUD2-226ENST00000593200 HOXB5P09067 269 aa7.15□□□□□ -1.26
EFTUD2-226ENST00000593200 OR5G3P0C626 314 aa7.15□□□□□ -1.26
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00869P0C866 280 aa7.15□□□□□ -1.26
EFTUD2-226ENST00000593200 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
EFTUD2-226ENST00000593200 TNFSF8P32971 234 aa7.15□□□□□ -1.26
EFTUD2-226ENST00000593200 PPP1R1AQ13522 171 aa7.15□□□□□ -1.26
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.15□□□□□ -1.26
EFTUD2-226ENST00000593200 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF503Q96F45 646 aa7.15□□□□□ -1.26
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
EFTUD2-226ENST00000593200 UPK3BQ9BT76 320 aa7.15□□□□□ -1.26
EFTUD2-226ENST00000593200 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
EFTUD2-226ENST00000593200 Q9H3A6 140 aa7.15□□□□□ -1.26
EFTUD2-226ENST00000593200 HERC1Q15751 4861 aa7.15□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 H7BYZ3 331 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 M6PRP20645 277 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 AP3S2P59780 193 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP10-2P60368 255 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 SELENOTP62341 195 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 ID3Q02535 119 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 OR5I1Q13606 314 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 S100A7AQ86SG5 101 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 TOMM5Q8N4H5 51 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 LRRC20Q8TCA0 184 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 BCL7BQ9BQE9 202 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 C20orf144Q9BQM9 153 aa7.14□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A0J9YY99 117 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1W2PPQ1 181 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 H3BNG1 76 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 ADAP1O75689 374 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 CXCL2P19875 107 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 TMBIM6P55061 237 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 KIR3DS1Q14943 382 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 ESRGQ1W209 222 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 PATE2Q6UY27 113 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 DEDD2Q8WXF8 326 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 ARL6Q9H0F7 186 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 PSENENQ9NZ42 101 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF24Q9Y225 148 aa7.13□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 FNDC10F2Z333 226 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 K7EPK0 472 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 CCNKO75909 580 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 RLN2P04090 185 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 HOXA5P20719 270 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 DLK1P80370 383 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 LCN15Q6UWW0 184 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 MCFD2Q8NI22 146 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC50A1Q9BRV3 221 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 ARV1Q9H2C2 271 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 NPVFQ9HCQ7 196 aa7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 GAGE12BA1L429 117 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 SSSCA1O60232 199 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 GAGE7O76087 117 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 METTL15P1P0C7V9 234 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 GAGE12FP0CL80 117 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 GAGE12GP0CL81 117 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 GAGE12IP0CL82 117 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC38A11Q08AI6 406 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 PYDC2Q56P42 97 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 PXDC1Q5TGL8 231 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 TEPPQ6URK8 271 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00305Q7Z4B0 112 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC190Q86UF4 302 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 SMIM8Q96KF7 97 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 V9GYH0 126 aa7.11□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 C9orf170A2RU37 121 aa7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 SNURFLB1AK76 121 aa7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 PRAC2D3DTV9 90 aa7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 H3BMQ9 156 aa7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC17A3O00476 420 aa7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF546Q86UE3 836 aa7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 OR10P1Q8NGE3 313 aa7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.1□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A096LPF7 62 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 GOSR2O14653 212 aa7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 NOL3O60936 208 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00315P59091 139 aa7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 163.4 ms