RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 SMPXQ9UHP9 88 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 A6NDN8 102 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 CENPXA8MT69 81 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 H0Y9J4 135 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 CRYZL1O95825 349 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 HPRT1P00492 218 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 APELAP0DMC3 54 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 MYL12AP19105 171 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 RAB4AP20338 218 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 DAPP51397 102 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF138P52744 262 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 C2orf83Q53S99 150 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 SPATA12Q7Z6I5 190 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 SPATA24Q86W54 205 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 OR10G4Q8NGN3 311 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 BORCS5Q969J3 196 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 SMIM19Q96E16 107 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 GINS4Q9BRT9 223 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 FAAP24Q9BTP7 215 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 OR2D2Q9H210 308 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 SDHAF2Q9NX18 166 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 BABAM2Q9NXR7 383 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 CELA1Q9UNI1 258 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 HERC1Q15751 4861 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 DEFB4AO15263 64 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 YIF1AO95070 293 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 PRH1P02810 166 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 CDK1P06493 297 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 HLA-GP17693 338 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 CELP19835 753 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 CCR6P51684 374 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 B2MP61769 119 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRM-208ENST00000578600 ST3GAL4Q11206 333 aa3.53□□□□□ -1.84
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PTPRM-208ENST00000578600 C12orf74Q32Q52 190 aa3.53□□□□□ -1.84
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PTPRM-208ENST00000578600 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa3.53□□□□□ -1.84
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PTPRM-208ENST00000578600 HTR2CP28335 458 aa3.51□□□□□ -1.85
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PTPRM-208ENST00000578600 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 Q56UQ5 140 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 Q5VSD8 79 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 IDO2Q6ZQW0 420 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 TCF24Q7RTU0 167 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 C6orf201Q7Z4U5 140 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRM-208ENST00000578600 GDPD1Q8N9F7 314 aa3.51□□□□□ -1.85
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