RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554945.1

SRP54-AS1-201, Transcript of SRP54 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3

Gene SRP54-AS1, Length 600 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SPANXN5Q5MJ07 72 aa6.56□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SSX7Q7RTT5 188 aa6.56□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 Q8N1X5 172 aa6.56□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.56□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa6.56□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RNF141Q8WVD5 230 aa6.56□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SOSTQ9BQB4 213 aa6.56□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa6.56□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 Q9H8V8 135 aa6.56□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.56□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A0A087X0K7 114 aa6.55□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HYPMO75409 117 aa6.55□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HTN1P15515 57 aa6.55□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CXCL3P19876 107 aa6.55□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 VAMP1P23763 118 aa6.55□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TNFSF8P32971 234 aa6.55□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 AP3S2P59780 193 aa6.55□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PLP1P60201 277 aa6.55□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SELENOTP62341 195 aa6.55□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TTC32Q5I0X7 151 aa6.55□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa6.55□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.55□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.55□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.55□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.55□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RNF24Q9Y225 148 aa6.55□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SMCO3A2RU48 225 aa6.54□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 H7BYZ3 331 aa6.54□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ADAP1O75689 374 aa6.54□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SFT2D2O95562 160 aa6.54□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 HOXB5P09067 269 aa6.54□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 OR5G3P0C626 314 aa6.54□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CDKN1BP46527 198 aa6.54□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMBIM6P55061 237 aa6.54□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa6.54□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SPATA12Q7Z6I5 190 aa6.54□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.54□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF503Q96F45 646 aa6.54□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.54□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 A0A1W2PPQ1 181 aa6.53□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 H3BP45 60 aa6.53□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LINC00869P0C866 280 aa6.53□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CXCL2P19875 107 aa6.53□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 M6PRP20645 277 aa6.53□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ID3Q02535 119 aa6.53□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PPP1R1AQ13522 171 aa6.53□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 OR5I1Q13606 314 aa6.53□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.53□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.53□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 UHRF2Q96PU4 802 aa6.53□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 Q9H3A6 140 aa6.53□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.53□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SCRT2Q9NQ03 307 aa6.53□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PSENENQ9NZ42 101 aa6.53□□□□□ -1.36
SRP54-AS1-201ENST00000554945 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.52□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 FNDC10F2Z333 226 aa6.52□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 H3BNG1 76 aa6.52□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.52□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DLK1P80370 383 aa6.52□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PYDC2Q56P42 97 aa6.52□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PXDC1Q5TGL8 231 aa6.52□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LCN15Q6UWW0 184 aa6.52□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CCDC28AQ8IWP9 274 aa6.52□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.52□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TRIM63Q969Q1 353 aa6.52□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 UPK3BQ9BT76 320 aa6.52□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.52□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ARL6Q9H0F7 186 aa6.52□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ARV1Q9H2C2 271 aa6.52□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.52□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.51□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SNURFLB1AK76 121 aa6.51□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 K7EPK0 472 aa6.51□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 RLN2P04090 185 aa6.51□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ESRGQ1W209 222 aa6.51□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 LCE4AQ5TA78 99 aa6.51□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 TEPPQ6URK8 271 aa6.51□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 PATE2Q6UY27 113 aa6.51□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 CCDC190Q86UF4 302 aa6.51□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 MCFD2Q8NI22 146 aa6.51□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SMIM8Q96KF7 97 aa6.51□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.51□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.51□□□□□ -1.37
SRP54-AS1-201ENST00000554945 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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