RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 LINC01548A6NM66 108 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRB-209ENST00000550857 GPHB5Q86YW7 130 aa6.43□□□□□ -1.38
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PTPRB-209ENST00000550857 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.43□□□□□ -1.38
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PTPRB-209ENST00000550857 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.43□□□□□ -1.38
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PTPRB-209ENST00000550857 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
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PTPRB-209ENST00000550857 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-209ENST00000550857 C5orf56Q8N8D9 126 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-209ENST00000550857 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-209ENST00000550857 GAGE12BA1L429 117 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-209ENST00000550857 H3BVH4 76 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRB-209ENST00000550857 GAGE7O76087 117 aa6.39□□□□□ -1.39
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