RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 DEFB114Q30KQ6 69 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 CLLU1Q5K131 121 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 TCF24Q7RTU0 167 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 MDFIQ99750 246 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 SMDT1Q9H4I9 107 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 AAMDCQ9H7C9 122 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 MLXQ9UH92 298 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 PRELID1Q9Y255 219 aa7.06□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 TRBV19A0A075B6N1 114 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 TRAV5A0A0B4J249 113 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 DNASE2O00115 360 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 ISLRO14498 428 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 IGLV1-51P01701 117 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 APOHP02749 345 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 IGLC2P0DOY2 106 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 IFITM2Q01629 132 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 ZNF726P1Q15940 193 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 FAM90A2PQ658T7 463 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 RXFP4Q8TDU9 374 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 FXYD5Q96DB9 178 aa7.05□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 NMBP08949 121 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 MORN5Q5VZ52 161 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 LEMD1Q68G75 181 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 IQCF2Q8IXL9 164 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 FAM110AQ9BQ89 295 aa7.04□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 F6UZH7 168 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 K7EQM0 130 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 OR10J4P0C629 311 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 PYYP10082 97 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 CSN1S1P47710 185 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 C16orf92Q96LL3 132 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 MS4A6AQ9H2W1 248 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 OTORQ9NRC9 128 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 MED9Q9NWA0 146 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 ZNF586Q9NXT0 402 aa7.03□□□□□ -1.28
CS-220ENST00000550700 H3BQ15 152 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 K7EQG2 157 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 PDE6DO43924 150 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 PEA15Q15121 130 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 SSX7Q7RTT5 188 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 CMTM2Q8TAZ6 248 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 BLNKQ8WV28 456 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 ZNF503Q96F45 646 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 VAX2Q9UIW0 290 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 RAB19A4D1S5 217 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 S100A9P06702 114 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 BCL2P10415 239 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 RANP62826 216 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 GUCA2BQ16661 112 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 NDUFA5Q16718 116 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 C5orf17Q8NAS9 161 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 DCANP1Q8TF63 244 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 HIST1H2BAQ96A08 127 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 FAM210AQ96ND0 272 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 GNG13Q9P2W3 67 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 SORL1Q92673 2214 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 PGPA6NDG6 321 aa7□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 FAM74A7A6NL05 159 aa7□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 PAGE4O60829 102 aa7□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 NDUFB4O95168 129 aa7□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 PSG3Q16557 428 aa7□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 ZNF506Q5JVG8 444 aa7□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 CST9LP1Q5W188 147 aa7□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 UQCC3Q6UW78 93 aa7□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 GTSCR1Q86UQ5 136 aa7□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 Q9H3A6 140 aa7□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa7□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 A0A1B0GV50 99 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 RBAKDNA6NC62 111 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 LINC00862A6NCI5 91 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-220ENST00000550700 C11orf94C9JXX5 98 aa6.99□□□□□ -1.29
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