RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM74A1Q5RGS3 127 aa4.1□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 FAM78BQ5VT40 261 aa4.1□□□□□ -1.75
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CLSTN3-215ENST00000544584 TMEM252Q8N6L7 170 aa4.1□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP4.1□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 AAMDCQ9H7C9 122 aa4.1□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC39A9Q9NUM3 307 aa4.1□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 XCL2Q9UBD3 114 aa4.1□□□□□ -1.75
CLSTN3-215ENST00000544584 PRELID1Q9Y255 219 aa4.1□□□□□ -1.75
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CLSTN3-215ENST00000544584 TIMM9Q9Y5J7 89 aa4.1□□□□□ -1.75
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CLSTN3-215ENST00000544584 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
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CLSTN3-215ENST00000544584 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa4.09□□□□□ -1.75
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CLSTN3-215ENST00000544584 PRR20DP86480 221 aa4.07□□□□□ -1.76
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CLSTN3-215ENST00000544584 C16orf74Q96GX8 76 aa4.07□□□□□ -1.76
CLSTN3-215ENST00000544584 LINC00477Q96M19 166 aa4.07□□□□□ -1.76
CLSTN3-215ENST00000544584 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
CLSTN3-215ENST00000544584 TRBV19A0A075B6N1 114 aa4.06□□□□□ -1.76
CLSTN3-215ENST00000544584 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa4.06□□□□□ -1.76
CLSTN3-215ENST00000544584 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa4.06□□□□□ -1.76
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
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