RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A087X0K7 114 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1W2PRE2 83 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00862A6NCI5 91 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PGPA6NDG6 321 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM74A7A6NL05 159 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BCL2P10415 239 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PMS2P11Q13670 270 aa6.42□□□□□ -1.38
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FAM90A2PQ658T7 463 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGFL4Q6B9Z1 124 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COMMD7Q86VX2 200 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.42□□□□□ -1.38
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00052Q96N35 136 aa6.42□□□□□ -1.38
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MS4A6AQ9H2W1 248 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q9H3A6 140 aa6.42□□□□□ -1.38
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NRN1Q9NPD7 142 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VAX2Q9UIW0 290 aa6.42□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 JMJD1CQ15652 2540 aa6.41□□□□□ -1.38
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C11orf94C9JXX5 98 aa6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC17A3O00476 420 aa6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NDUFB4O95168 129 aa6.41□□□□□ -1.38
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ATP5G3P48201 142 aa6.41□□□□□ -1.38
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.41□□□□□ -1.38
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM61Q8N0U2 210 aa6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LYPD1Q8N2G4 141 aa6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.41□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.41□□□□□ -1.38
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.41□□□□□ -1.38
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR4C46A6NHA9 309 aa6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TSPAN4O14817 238 aa6.4□□□□□ -1.38
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGLV1-51P01701 117 aa6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGLL1P15814 213 aa6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CSN1S1P47710 185 aa6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CEBPGP53567 150 aa6.4□□□□□ -1.38
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF182Q8N6D2 247 aa6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 OR2K2Q8NGT1 345 aa6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TXNDC17Q9BRA2 123 aa6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MED9Q9NWA0 146 aa6.4□□□□□ -1.38
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa6.4□□□□□ -1.38
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 F6UZH7 168 aa6.39□□□□□ -1.39
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ISLRO14498 428 aa6.39□□□□□ -1.39
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CD81P60033 236 aa6.39□□□□□ -1.39
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LCN12Q6JVE5 192 aa6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF738Q8NE65 137 aa6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DCANP1Q8TF63 244 aa6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CITED4Q96RK1 184 aa6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EPDR1Q9UM22 224 aa6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PRELID1Q9Y255 219 aa6.39□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NF1P21359 2839 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRAV2A0A0B4J234 112 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 M0R3E3 92 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SOCS3O14543 225 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SRP19P09132 144 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ZNF688P0C7X2 276 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GNG5P63218 68 aa6.38□□□□□ -1.39
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PSMG4Q5JS54 123 aa6.38□□□□□ -1.39
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