RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523628.5

HDAC2-216, Transcript of histone deacetylase 2, humanhuman

TSL 4

Gene HDAC2, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2-216ENST00000523628 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 GFRA4Q9GZZ7 299 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 FXYD6Q9H0Q3 95 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 NAA60Q9H7X0 242 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 EXTL2Q9UBQ6 330 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa3.05□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 CEBPZOSA8MTT3 80 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 J3QRK9 145 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 K7EP13 123 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 TMEM50AO95807 157 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 CA1P00915 261 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 IFNA10P01566 189 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 IFNA21P01568 189 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 CD3DP04234 171 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 REG1AP05451 166 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 P0C879 139 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 RD3LP0DJH9 198 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 TSPOP30536 169 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 P2RY1P47900 373 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 INPP1P49441 399 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 RAB31Q13636 194 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 IL18Q14116 193 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 DEFB135Q30KP9 77 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 NMSQ5H8A3 153 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 SPANXN2Q5MJ10 180 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 TOMM20LQ6UXN7 152 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 FOXI2Q6ZQN5 318 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 LINC00299Q6ZSB3 139 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 Q6ZVQ6 151 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 SNX29P2Q8IUI4 249 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 C15orf53Q8NAA6 179 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 BPIFCQ8NFQ6 507 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 OR1B1Q8NGR6 318 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 OR5H6Q8NGV6 325 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 OR11H2Q8NH07 326 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 DIRAS2Q96HU8 199 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 ZNF414Q96IQ9 312 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 RNF2Q99496 336 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 TRGV9Q99603 122 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 NDUFAF3Q9BU61 184 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 GGACTQ9BVM4 153 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 MS4A6AQ9H2W1 248 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 KCNIP2Q9NS61 270 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 RPRMQ9NS64 109 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 TBC1D24Q9ULP9 559 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa3.04□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 A0A0J9YWU9 116 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 A0A1B0GW64 132 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 IZUMO1RA6ND01 250 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 ZFP92A6NM28 416 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 E7EUB6 86 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 K7EQG2 157 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 WRBO00258 174 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 LY6G6CO95867 125 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 IL4P05112 153 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 SPART-AS1P0CW21 52 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 RNASE2P10153 161 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 HLA-DRB4P13762 266 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 RPL7P18124 248 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 ELK1P19419 428 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 C4BPBP20851 252 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 TAS2R30P59541 319 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 DHRS2Q13268 280 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 GUK1Q16774 197 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 RNF212Q495C1 297 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 LEMD1Q68G75 181 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 ZFAND6Q6FIF0 208 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 TOMM5Q8N4H5 51 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 STXBP6Q8NFX7 210 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 OR10W1Q8NGF6 305 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 OR13C8Q8NGS7 320 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 OR1S1Q8NH92 325 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 COQ8AQ8NI60 647 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 DTD1Q8TEA8 209 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 CHRDL1Q9BU40 450 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 SH3BGRL3Q9H299 93 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 NDUFA13Q9P0J0 144 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 RFNGQ9Y644 331 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 LYSTQ99698 3801 aa3.03□□□□□ -1.92
HDAC2-216ENST00000523628 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 FABP12A6NFH5 140 aa3.02□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 CCDC160A6NGH7 325 aa3.02□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 LYRM9A8MSI8 78 aa3.02□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 K7EPK0 472 aa3.02□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 K7EQD1 137 aa3.02□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 SOCS3O14543 225 aa3.02□□□□□ -1.93
HDAC2-216ENST00000523628 HPGDSO60760 199 aa3.02□□□□□ -1.93
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