RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 C16orf54Q6UWD8 224 aa11.74□□□□□ -0.53
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TRPS1-206ENST00000517323 SGK494Q96LW2 274 aa11.74□□□□□ -0.53
TRPS1-206ENST00000517323 OR4F4Q96R69 305 aa11.74□□□□□ -0.53
TRPS1-206ENST00000517323 ASCL2Q99929 193 aa11.74□□□□□ -0.53
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TRPS1-206ENST00000517323 CMYA5Q8N3K9 4069 aa11.74□□□□□ -0.53
TRPS1-206ENST00000517323 PSMB3P49720 205 aa11.74□□□□□ -0.53
TRPS1-206ENST00000517323 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa11.74□□□□□ -0.53
TRPS1-206ENST00000517323 LINC00052Q96N35 136 aa11.74□□□□□ -0.53
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TRPS1-206ENST00000517323 OR4F17Q8NGA8 305 aa11.73□□□□□ -0.53
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TRPS1-206ENST00000517323 K7EMT4 169 aa11.71□□□□□ -0.53
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TRPS1-206ENST00000517323 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-206ENST00000517323 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-206ENST00000517323 F8W036 122 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-206ENST00000517323 SOCS3O14543 225 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-206ENST00000517323 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-206ENST00000517323 C12orf54Q6X4T0 127 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-206ENST00000517323 NHLRC2Q8NBF2 726 aa11.65□□□□□ -0.54
TRPS1-206ENST00000517323 DCANP1Q8TF63 244 aa11.65□□□□□ -0.54
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