RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 PPIFP30405 207 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 PDE6HQ13956 83 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 NHLRC2Q8NBF2 726 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 NUDT10Q8NFP7 164 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 NUDT11Q96G61 164 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 GRAMD2BQ96HH9 432 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF492Q9P255 531 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 PITPNC1Q9UKF7 332 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa8.36□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 VPS13CQ709C8 3753 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 CLPSL1A2RUU4 121 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 C19orf71A6NCJ1 209 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM223BA6NKX1 122 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF785A8K8V0 405 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 H3BUA1 57 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 GATCO43716 136 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR183P32249 361 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 MEOX2P50222 304 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 UBE2G1P62253 170 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP5G2Q06055 141 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 LY6EQ16553 131 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 GFI1BQ5VTD9 330 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM183AQ8IXX5 376 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 MS4A10Q96PG2 267 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 PRSS22Q9GZN4 317 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 RABAC1Q9UI14 185 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF580Q9UK33 172 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 U3KQE9 123 aa8.35□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 IZUMO1RA6ND01 250 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 BMPR1BO00238 502 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF253O75346 499 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHV4-31P0DP07 118 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 RPL7P18124 248 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 S100A7P31151 101 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 Q86TA4 180 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 CMTM2Q8TAZ6 248 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 SGK494Q96LW2 274 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP2-209ENST00000504450 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 A0A087X0K7 114 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 DIRC3C9JPN6 131 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 BUB3O43684 328 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 BLCAPP62952 87 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 PSG9Q00887 426 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 CFHR3Q02985 330 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 DEFB112Q30KQ8 113 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 COX19Q49B96 90 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 PRSS57Q6UWY2 283 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 C9orf139Q6ZV77 190 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM75Q8N9X5 138 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR61Q9BZJ8 451 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 LINC00527Q9UJ94 153 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 RPH3ALQ9UNE2 315 aa8.33□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 TRAV8-1A0A0A6YYK1 113 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 RNF223E7ERA6 249 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 TGFAP01135 160 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 IGLV1-40P01703 118 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 IGHG4P01861 327 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 TRGV3P03979 118 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 SMIM6P0DI80 62 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 CBLN1P23435 193 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 RAB9AP51151 201 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 CT83Q5H943 113 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 C9orf152Q5JTZ5 239 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 C1orf194Q5T5A4 169 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 Q6ZS46 218 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 TSKUQ8WUA8 353 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 USMG5Q96IX5 58 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 C12orf57Q99622 126 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 PSG8Q9UQ74 426 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 FN1P02751 2386 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 SERTM2A0A1B0GWG4 89 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 XKRY2A2RUG3 117 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 M0R3E3 92 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 CA1P00915 261 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 IER3P46695 156 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 RELQ04864 619 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 PSG3Q16557 428 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP2-209ENST00000504450 WDR73Q6P4I2 378 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms