RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 USP24Q9UPU5 2620 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 ASPMQ8IZT6 3477 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 ADGRB1O14514 1584 aa2.78□□□□□ -1.96
PTPRC-212ENST00000491302 FBN3Q75N90 2809 aa2.78□□□□□ -1.97
PTPRC-212ENST00000491302 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-212ENST00000491302 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-212ENST00000491302 KIF1BO60333 1816 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-212ENST00000491302 PTPN13Q12923 2485 aa2.77□□□□□ -1.97
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PTPRC-212ENST00000491302 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-212ENST00000491302 TMEM212A6NML5 194 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
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PTPRC-212ENST00000491302 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP2.77□□□□□ -1.97
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PTPRC-212ENST00000491302 OR5AC2Q9NZP5 309 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRC-212ENST00000491302 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
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PTPRC-212ENST00000491302 ABCC6O95255 1503 aa2.77□□□□□ -1.97
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PTPRC-212ENST00000491302 CYBAP13498 195 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-212ENST00000491302 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
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PTPRC-212ENST00000491302 SLC50A1Q9BRV3 221 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-212ENST00000491302 TAS2R4Q9NYW5 299 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-212ENST00000491302 C4BP0C0L5 1744 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-212ENST00000491302 E9PCH4 1651 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRC-212ENST00000491302 ABCA12Q86UK0 2595 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-212ENST00000491302 TAF1LQ8IZX4 1826 aa2.75□□□□□ -1.97
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV4A0A0B4J268 109 aa2.75□□□□□ -1.97
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PTPRC-212ENST00000491302 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa2.75□□□□□ -1.97
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PTPRC-212ENST00000491302 TRBV19A0A075B6N1 114 aa2.74□□□□□ -1.97
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PTPRC-212ENST00000491302 BAALC-AS2P0C853 105 aa2.74□□□□□ -1.97
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PTPRC-212ENST00000491302 RHOBP62745 196 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-212ENST00000491302 C12orf29Q8N999 325 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRC-212ENST00000491302 MYO18BQ8IUG5 2567 aa2.74□□□□□ -1.97
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PTPRC-212ENST00000491302 HACD4Q5VWC8 232 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-212ENST00000491302 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa2.72□□□□□ -1.97
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PTPRC-212ENST00000491302 DOT1LQ8TEK3 1739 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-212ENST00000491302 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa2.72□□□□□ -1.97
PTPRC-212ENST00000491302 SPEGQ15772 3267 aa2.72□□□□□ -1.97
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PTPRC-212ENST00000491302 SSC5DA1L4H1 1573 aa2.71□□□□□ -1.98
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PTPRC-212ENST00000491302 IFNA7P01567 189 aa2.71□□□□□ -1.98
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PTPRC-212ENST00000491302 MIFP14174 115 aa2.71□□□□□ -1.98
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PTPRC-212ENST00000491302 CDK5R1Q15078 307 aa2.71□□□□□ -1.98
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PTPRC-212ENST00000491302 AQP3Q92482 292 aa2.71□□□□□ -1.98
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PTPRC-212ENST00000491302 KDM3BQ7LBC6 1761 aa2.71□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 C2CD3Q4AC94 2353 aa2.71□□□□□ -1.98
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PTPRC-212ENST00000491302 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 CPDO75976 1380 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0G2JMZ2 1700 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 BPTFQ12830 3046 aa2.7□□□□□ -1.98
PTPRC-212ENST00000491302 FAM186AA6NE01 2351 aa2.69□□□□□ -1.98
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