RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489842.1

GTF3C5-210, Transcript of general transcription factor IIIC subunit 5, humanhuman

TSL 2

Gene GTF3C5, Length 696 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C5-210ENST00000489842 MEOX2P50222 304 aa6.41□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 RAP2BP61225 183 aa6.41□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 RPP30P78346 268 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 Q6ZR54 194 aa6.41□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 OR8A1Q8NGG7 326 aa6.41□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 MGST2Q99735 147 aa6.41□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.41□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 ARV1Q9H2C2 271 aa6.41□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.41□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 TRAV6A0A075B6T7 132 aa6.4□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 C7orf66A4D0T2 115 aa6.4□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.4□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa6.4□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 AGPAT2O15120 278 aa6.4□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 INSP01308 110 aa6.4□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 IFNA21P01568 189 aa6.4□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 DLK1P80370 383 aa6.4□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 PSG3Q16557 428 aa6.4□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa6.4□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 LINC00299Q6ZSB3 139 aa6.4□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.4□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 LINC01587Q99440 93 aa6.4□□□□□ -1.38
GTF3C5-210ENST00000489842 FAM25EA8MYX2 175 aa6.39□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 F5H768 121 aa6.39□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 H3BQ15 152 aa6.39□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 CST7O76096 145 aa6.39□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 NUDT3O95989 172 aa6.39□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 CFDP00746 253 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 PLP1P60201 277 aa6.39□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 OPCMLQ14982 345 aa6.39□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 LGALS9BQ3B8N2 356 aa6.39□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 MIC13Q5XKP0 118 aa6.39□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 LINC00336Q6ZUF6 198 aa6.39□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 LINC00305Q7Z4B0 112 aa6.39□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 OR10P1Q8NGE3 313 aa6.39□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.39□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 MITD1Q8WV92 249 aa6.39□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 C20orf85Q9H1P6 137 aa6.39□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 C11orf1Q9H5F2 150 aa6.39□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 NPVFQ9HCQ7 196 aa6.39□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 A0A087X0K7 114 aa6.38□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.38□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 K7EPK0 472 aa6.38□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 TNP2Q05952 138 aa6.38□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 TEPPQ6URK8 271 aa6.38□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 GPR82Q96P67 336 aa6.38□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 MGAT4CQ9UBM8 478 aa6.38□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa6.37□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 IGSF23A1L1A6 192 aa6.37□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 GOSR2O14653 212 aa6.37□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 COX7A2P2O60397 106 aa6.37□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 TSC22D2O75157 780 aa6.37□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 BCAP31P51572 246 aa6.37□□□□□ -1.39
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GTF3C5-210ENST00000489842 ERCC8Q13216 396 aa6.37□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 OXA1LQ15070 435 aa6.37□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 GCSAMLQ5JQS6 135 aa6.37□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.37□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 Q6ZQT7 251 aa6.37□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 NRARPQ7Z6K4 114 aa6.37□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 RNF141Q8WVD5 230 aa6.37□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.37□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.37□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.37□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 A0A0J9YY99 117 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 C5orf51A6NDU8 294 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 LYRM9A8MSI8 78 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 M0R3E3 92 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 LYRM1O43325 122 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 SIX6O95475 246 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 TCRBP04435 133 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 CT45A10P0DMU9 189 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 HOXA5P20719 270 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 CAV2P51636 162 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 ZNRF2Q8NHG8 242 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 ATG101Q9BSB4 218 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.36□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.35□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa6.35□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 GAGE12BA1L429 117 aa6.35□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 CENPXA8MT69 81 aa6.35□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 L7N2F9 121 aa6.35□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 GAGE7O76087 117 aa6.35□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 GAGE12FP0CL80 117 aa6.35□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 GAGE12GP0CL81 117 aa6.35□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 GAGE12IP0CL82 117 aa6.35□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 IGLC2P0DOY2 106 aa6.35□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 PYYP10082 97 aa6.35□□□□□ -1.39
GTF3C5-210ENST00000489842 CDKN1BP46527 198 aa6.35□□□□□ -1.39
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