RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 MED21Q13503 144 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 GRK1Q15835 563 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 LTC4SQ16873 150 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 DEFB135Q30KP9 77 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM27D1Q5T7N8 215 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 NXNL2Q5VZ03 156 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF767PQ75MW2 155 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 SPATA24Q86W54 205 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 GID4Q8IVV7 300 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP1.51□□□□□ -2.17
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RABGGTB-211ENST00000489450 OR4D6Q8NGJ1 314 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP1.51□□□□□ -2.17
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RABGGTB-211ENST00000489450 APOL4Q9BPW4 351 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 C20orf144Q9BQM9 153 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 COPS4Q9BT78 406 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 GPR84Q9NQS5 396 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 BATF3Q9NR55 127 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC7A11Q9UPY5 501 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 POLR1DQ9Y2S0 133 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 MPC1Q9Y5U8 109 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 V9GYS6 101 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAV41A0A0B4J266 112 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ODAMA1E959 279 aa1.5□□□□□ -2.17
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RABGGTB-211ENST00000489450 OR11H12B2RN74 326 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 GNGT2O14610 69 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 SULT1C4O75897 302 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 SOX14O95416 240 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 IFNGP01579 166 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 HLA-DRB1P01911 266 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 APOC1P02654 83 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 PRH1P02810 166 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF3P17036 446 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 HLA-GP17693 338 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ALOX5APP20292 161 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 CCL1P22362 96 aa1.5□□□□□ -2.17
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RABGGTB-211ENST00000489450 NFYBP25208 207 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 CRABP1P29762 137 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ERP29P30040 261 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 GNRHRP30968 328 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 PSMB2P49721 201 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF137PP52743 207 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 SLC35B1P78383 322 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 PMVKQ15126 192 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAM1Q15629 374 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 DEFB114Q30KQ6 69 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 SMIM21Q3B7S5 101 aa1.5□□□□□ -2.17
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RABGGTB-211ENST00000489450 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 Q5VSD8 79 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 C12orf73Q69YU5 71 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 DNM1P34Q6PK57 102 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 FA2HQ7L5A8 372 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 HS3ST5Q8IZT8 346 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 SYS1Q8N2H4 156 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00311Q8N616 119 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00337Q8N6G1 96 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 Q8NAQ8 132 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF555Q8NEP9 628 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 OR5A2Q8NGI9 324 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 OR6K6Q8NGW6 343 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 OR6N2Q8NGY6 317 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 TEX47Q8TBZ9 253 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 PYDC1Q8WXC3 89 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 RBPMSQ93062 196 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
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RABGGTB-211ENST00000489450 NIPSNAP1Q9BPW8 284 aa1.5□□□□□ -2.17
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RABGGTB-211ENST00000489450 FBXL15Q9H469 300 aa1.5□□□□□ -2.17
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RABGGTB-211ENST00000489450 VCX3AQ9NNX9 186 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 OR2S2Q9NQN1 319 aa1.5□□□□□ -2.17
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RABGGTB-211ENST00000489450 CMC2Q9NRP2 79 aa1.5□□□□□ -2.17
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RABGGTB-211ENST00000489450 RASL12Q9NYN1 266 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 TPRKBQ9Y3C4 175 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 R4GN34 69 aa1.5□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP1.49□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A087WXM4 84 aa1.49□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa1.49□□□□□ -2.17
RABGGTB-211ENST00000489450 hADV38S2A0JD32 116 aa1.49□□□□□ -2.17
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