RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 TRIM63Q969Q1 353 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 C16orf74Q96GX8 76 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 HIGD1AQ9Y241 93 aa6.54□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A087X0K7 114 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 SMCO3A2RU48 225 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 FABP12A6NFH5 140 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 HYPMO75409 117 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 IL5P05113 134 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 HOXB5P09067 269 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00869P0C866 280 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 TNFSF8P32971 234 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 RAP2BP61225 183 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 PPP1R1AQ13522 171 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 PSG3Q16557 428 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 UHRF2Q96PU4 802 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 SFT2D2O95562 160 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5G3P0C626 314 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 AP3S2P59780 193 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 PLP1P60201 277 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5I1Q13606 314 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 KIR3DS1Q14943 382 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 TTC32Q5I0X7 151 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF493Q6ZR52 646 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 Q9H8V8 135 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 RNF213Q63HN8 5207 aa6.52□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM229AH3BQW9 127 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 H7BYZ3 331 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 M6PRP20645 277 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 HOXA5P20719 270 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 CDKN1BP46527 198 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 TMBIM6P55061 237 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP10-1P60331 282 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 SELENOTP62341 195 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 OR10J6PQ8NGY7 276 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 MCFD2Q8NI22 146 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 LRRC20Q8TCA0 184 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 ARL6Q9H0F7 186 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 Q9H3A6 140 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 PTTG2Q9NZH5 202 aa6.51□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A0J9YY99 117 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 PMS2P5A8MQ11 134 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 PRAC2D3DTV9 90 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 K7EPK0 472 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 SSSCA1O60232 199 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 ADAP1O75689 374 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 CCNKO75909 580 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 ID3Q02535 119 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 ESRGQ1W209 222 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 PYDC2Q56P42 97 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 PATE2Q6UY27 113 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 TOMM5Q8N4H5 51 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 UPK3BQ9BT76 320 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 PSENENQ9NZ42 101 aa6.5□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 GAGE12BA1L429 117 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 H3BMQ9 156 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 GAGE7O76087 117 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 METTL15P1P0C7V9 234 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 GAGE12FP0CL80 117 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 GAGE12GP0CL81 117 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 GAGE12IP0CL82 117 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 CXCL2P19875 107 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 ANXA7P20073 488 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC38A11Q08AI6 406 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 ICAM4Q14773 271 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 LCN15Q6UWW0 184 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 S100A7AQ86SG5 101 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 SMIM8Q96KF7 97 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 C20orf144Q9BQM9 153 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 ARV1Q9H2C2 271 aa6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMARCE1-210ENST00000481231 V9GYH0 126 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.1 ms