RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 ACTL10Q5JWF8 245 aa16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 EBLN2Q6P2I7 272 aa16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC25A2Q9BXI2 301 aa16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 SH3BGRL3Q9H299 93 aa16.11■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa16.1■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa16.1■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 RAB2AP61019 212 aa16.1■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 HAGHQ16775 308 aa16.1■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM122CQ6P4D5 195 aa16.1■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 TMUB2Q71RG4 321 aa16.1■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 SBSPONQ8IVN8 264 aa16.1■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 KIR2DL5AQ8N109 375 aa16.1■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa16.1■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 PAXXQ9BUH6 204 aa16.1■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 OR51M1Q9H341 326 aa16.1■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 TMEM41BQ5BJD5 291 aa16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 FOXI2Q6ZQN5 318 aa16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF738Q8NE65 137 aa16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 SPATA25Q9BR10 227 aa16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 CYTL1Q9NRR1 136 aa16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 RFNGQ9Y644 331 aa16.09■□□□□ 0.17
RALGPS1-212ENST00000472427 KNCNA6PVL3 124 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 UBE2CO00762 179 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF253O75346 499 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 PYYP10082 97 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 PSG9Q00887 426 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 PDE6HQ13956 83 aa16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 H3BQ15 152 aa16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 PQLC2Q6ZP29 291 aa16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 C17orf77Q96MU5 243 aa16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 SAV1Q9H4B6 383 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 TRBV19A0A075B6N1 114 aa16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 H3BTX0 84 aa16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 SPP1P10451 314 aa16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 TPT1P13693 172 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 HLA-DRB4P13762 266 aa16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 PSG3Q16557 428 aa16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 RNF182Q8N6D2 247 aa16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 BLNKQ8WV28 456 aa16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 RNF141Q8WVD5 230 aa16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 CSTL1Q9H114 145 aa16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 AAMDCQ9H7C9 122 aa16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF586Q9NXT0 402 aa16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa16.06■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 IGFL4Q6B9Z1 124 aa16.05■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 TM2D3Q9BRN9 247 aa16.05■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 OR10J4P0C629 311 aa16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 NBEAP1P0C6P0 100 aa16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 C20orf173Q96LM9 149 aa16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 PRELID1Q9Y255 219 aa16.04■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 H3BMM0 161 aa16.03■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC17A3O00476 420 aa16.03■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 CA1P00915 261 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 SEC11BP0C7V7 166 aa16.03■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 LGALSLQ3ZCW2 172 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 BAP18Q8IXM2 172 aa16.03■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 RPP25LQ8N5L8 163 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 RAB24Q969Q5 203 aa16.03■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 FXYD5Q96DB9 178 aa16.03■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 A0A0J9YX75 114 aa16.02■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 Q6ZWC4 215 aa16.02■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 OR4B1Q8NGF8 309 aa16.02■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
RALGPS1-212ENST00000472427 UMAD1C9J7I0 102 aa16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-212ENST00000472427 CD300CQ08708 224 aa16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-212ENST00000472427 STOML3Q8TAV4 291 aa16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-212ENST00000472427 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa16.01■□□□□ 0.15
RALGPS1-212ENST00000472427 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa16■□□□□ 0.15
RALGPS1-212ENST00000472427 F6UB75 175 aa16■□□□□ 0.15
RALGPS1-212ENST00000472427 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RALGPS1-212ENST00000472427 CXorf1O96002 111 aa16■□□□□ 0.15
RALGPS1-212ENST00000472427 IGKV3-20P01619 116 aa16■□□□□ 0.15
RALGPS1-212ENST00000472427 STAG3L2P0CL84 134 aa16■□□□□ 0.15
RALGPS1-212ENST00000472427 STAG3L3P0CL85 134 aa16■□□□□ 0.15
RALGPS1-212ENST00000472427 ARL14EPLP0DKL9 152 aa16■□□□□ 0.15
RALGPS1-212ENST00000472427 HLA-DMBP28068 263 aa16■□□□□ 0.15
RALGPS1-212ENST00000472427 GDF5OSQ5U4N7 250 aa16■□□□□ 0.15
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC51BQ86UW2 128 aa16■□□□□ 0.15
RALGPS1-212ENST00000472427 LYPD1Q8N2G4 141 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.2 ms